247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0173 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  100 
 
 
222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  99.1 
 
 
222 aa  447  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  41.89 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  41.44 
 
 
227 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  41.18 
 
 
226 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  41.82 
 
 
227 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  41.82 
 
 
227 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  42.66 
 
 
226 aa  190  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  40.72 
 
 
227 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  40.72 
 
 
227 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  40.72 
 
 
227 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  45.16 
 
 
220 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  40.93 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  40.93 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  42.99 
 
 
224 aa  177  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  41.01 
 
 
223 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  38.16 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  38.36 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  38.01 
 
 
220 aa  161  9e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  41.7 
 
 
211 aa  145  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  33.93 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  39.91 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  37.5 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  37.04 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  37.38 
 
 
218 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  33.49 
 
 
208 aa  119  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  33.95 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  37.5 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  32.74 
 
 
215 aa  115  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  39.72 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  32.41 
 
 
202 aa  113  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  33.03 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  32.88 
 
 
215 aa  112  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  33.95 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  33.65 
 
 
214 aa  108  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  31.02 
 
 
215 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  31.98 
 
 
208 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  33.33 
 
 
209 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  30.05 
 
 
201 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  30.05 
 
 
201 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  30.7 
 
 
232 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  27.7 
 
 
201 aa  98.6  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  30.05 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  26.05 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  30.77 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  29.63 
 
 
210 aa  91.7  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  29.86 
 
 
210 aa  88.6  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  29.09 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  30.06 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  30.91 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  32.51 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  30.7 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  27.59 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  31.98 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  30.23 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  27.85 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  29.7 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  25.69 
 
 
200 aa  82  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  27.52 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  31.21 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  26.85 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  29.95 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  29.41 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  29.3 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  29.41 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  29.11 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  29.11 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  29.65 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  29.11 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  29.11 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  29.15 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  27.46 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  30.13 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  27.44 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  27.88 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  30.09 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  29.35 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  25.11 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  29.81 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  26.48 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  24.66 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  25.45 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  28.44 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  30.54 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  24.22 
 
 
217 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  29.26 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  28.64 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  24.88 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  26.43 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  24.88 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  30.39 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  25.76 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  23.83 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  27.96 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.38 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  27.27 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  26.56 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  25.37 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  25.57 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  24.88 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>