184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4284 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  100 
 
 
232 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  66.51 
 
 
210 aa  296  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  54.76 
 
 
212 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  51.43 
 
 
211 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  55.56 
 
 
210 aa  225  4e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  49.28 
 
 
233 aa  218  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  50.96 
 
 
210 aa  211  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  47.14 
 
 
211 aa  207  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  50.48 
 
 
209 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  50.24 
 
 
216 aa  189  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  44.28 
 
 
211 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  40.58 
 
 
210 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  41.06 
 
 
209 aa  168  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  42.21 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  36.59 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  34.34 
 
 
215 aa  126  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  32.84 
 
 
214 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  35.47 
 
 
215 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  32.21 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  36.27 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  32.86 
 
 
218 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  32.5 
 
 
208 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  32.04 
 
 
219 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  33.33 
 
 
208 aa  105  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  32.66 
 
 
215 aa  103  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  32.16 
 
 
215 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  34.18 
 
 
209 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  29.77 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  30.7 
 
 
222 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  31.38 
 
 
199 aa  96.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  29.59 
 
 
211 aa  95.5  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  28.71 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  31.77 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  27.72 
 
 
199 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  34.62 
 
 
213 aa  89  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  28.79 
 
 
227 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  32.86 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  28.77 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  32.29 
 
 
206 aa  85.9  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  28.26 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  32.37 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  26.83 
 
 
226 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  28.43 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.83 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.87 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  29.7 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.83 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  32.38 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  27.37 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.83 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  26.37 
 
 
227 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  31.9 
 
 
217 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  30.13 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.92 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  29.7 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  28.26 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  26.32 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  28.11 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  28.87 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  27.27 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  27.8 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  27.8 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  28.99 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  30.15 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  26.19 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  26.32 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  28.24 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  25.96 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  26.03 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  26.19 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  25.96 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  26.73 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  26.44 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  26.73 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  26.42 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  23.56 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  28.08 
 
 
219 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  25.96 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  30.88 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  31.78 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  25.96 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  26.63 
 
 
219 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  26.63 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  28.49 
 
 
202 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  24.6 
 
 
213 aa  62  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  29.33 
 
 
217 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  24.88 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  25.96 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0456  nitroreductase  25.11 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  25.93 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  37.97 
 
 
201 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>