195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3715 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  95.85 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  95.39 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  92.63 
 
 		 217 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  92.17 
 
 		 217 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  89.4 
 
 		 217 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  89.4 
 
 		 217 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  89.4 
 
 		 217 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  89.4 
 
 		 217 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  76.5 
 
 		 217 aa  343  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  74.65 
 
 		 217 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  76.04 
 
 		 217 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  59.72 
 
 		 217 aa  278  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  57.82 
 
 		 217 aa  269  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  57.94 
 
 		 217 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  57.48 
 
 		 217 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  56.07 
 
 		 217 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  62.2 
 
 		 217 aa  258  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  56.07 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  55.56 
 
 		 217 aa  251  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  55.09 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  55.09 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  55.09 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  53.7 
 
 		 216 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  57.69 
 
 		 218 aa  247  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  55.09 
 
 		 217 aa  244  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  55.09 
 
 		 217 aa  244  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  54.42 
 
 		 217 aa  244  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  54.63 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  56.02 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  54.63 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  54.63 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  55.09 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  54.63 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  54.17 
 
 		 217 aa  241  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  54.63 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  51.64 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  55.5 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  50.47 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  35.32 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  35.15 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  33.49 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  33 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  32.23 
 
 		 218 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  33.5 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  31.55 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  33.33 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  32.23 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  32.06 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  32.06 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  31.34 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  30.19 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  30.62 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  30.33 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  30.18 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  28.02 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  27.75 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  32.21 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.9 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  31.56 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  29.52 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  33.67 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  31.78 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  30.14 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.91 
 
 		 227 aa  91.7  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  30.95 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.91 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.91 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  31.22 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  31.92 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  31.28 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  27.14 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  31.88 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  31.58 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  28.97 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  28.7 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  28.91 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  28.7 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  32.68 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  30.11 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  28.24 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.17 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  30.14 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  30.09 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  30.23 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  27.03 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  28.5 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  28.77 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  30.85 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  30.63 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  29.84 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  26.17 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  28.16 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  28.16 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  26.57 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  27.84 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  26.11 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  27.18 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  30.15 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  24.37 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>