208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4487 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  66.51 
 
 
232 aa  296  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  53.85 
 
 
233 aa  237  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  54.5 
 
 
211 aa  236  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  57 
 
 
210 aa  235  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  51.66 
 
 
211 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  52.38 
 
 
212 aa  221  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  53.11 
 
 
210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  50 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  44.98 
 
 
211 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  46.38 
 
 
209 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  41.06 
 
 
210 aa  177  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  48.08 
 
 
209 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  40.98 
 
 
214 aa  156  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  41.06 
 
 
210 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  35.71 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  30.92 
 
 
224 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  34.98 
 
 
208 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  32.06 
 
 
215 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  32.85 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  34.76 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  31.31 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  33.95 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  36.32 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  35 
 
 
209 aa  107  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  34.04 
 
 
199 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  32.58 
 
 
217 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  33.02 
 
 
215 aa  102  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  31.02 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  31.02 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  33.48 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  29.79 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  32.13 
 
 
217 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  34.09 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  32.45 
 
 
209 aa  92  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  29.63 
 
 
222 aa  91.7  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  29.63 
 
 
222 aa  91.3  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  30.32 
 
 
211 aa  87.8  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  31.12 
 
 
235 aa  87  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  30.46 
 
 
218 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  31.44 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  29.03 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  29.58 
 
 
200 aa  84  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  29.22 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  31.86 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28 
 
 
227 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  28.38 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  26.61 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  27.5 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  29.59 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  29.08 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.5 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.5 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  31.22 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  28.7 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.5 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  25.14 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  30.57 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  26.17 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  27.96 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  26.17 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  26.26 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  28.57 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  28.11 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  24.59 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  27.45 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  26.87 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  25.7 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.5 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  30.77 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  24.04 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  24.77 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  24.77 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  30 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  30 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  30 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  24.77 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  24.77 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  29.55 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  30.16 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  28.43 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  30 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  29.91 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  28.5 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  26.61 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  26.94 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  28.85 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  29.55 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  29.55 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  30.06 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  29.36 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  29.36 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  26.94 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  26.48 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  26.64 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  27.7 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  26.46 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  30.54 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>