171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2776 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  100 
 
 		 215 aa  447  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  67.31 
 
 		 208 aa  295  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  40.8 
 
 		 224 aa  177  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  45 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  37.86 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  39.25 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  38.14 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  36.02 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  37.68 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  37.16 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  35.58 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  39.15 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  35.18 
 
 		 212 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  30.54 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  34.76 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  34.3 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  32.37 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  34.29 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  33.98 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  37.06 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  32.16 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  34.29 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  34.3 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  32.06 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  31.43 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  33.98 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  33.5 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  33.5 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  28.57 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  31.8 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  32.41 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  31.4 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  32.56 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  31.88 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  30.77 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  30.77 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  30.77 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  32.3 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  34.45 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  30.77 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  32.21 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  34.65 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.26 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.26 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.26 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  32.66 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  29.65 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  30.7 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  30.87 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  27.05 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  31.3 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  33.66 
 
 		 218 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  30.63 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  30.63 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  28.04 
 
 		 199 aa  94.7  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  30.45 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  29.58 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  28.08 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  27.83 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  33.02 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.26 
 
 		 227 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.14 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  30.84 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  26.82 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  28.78 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  30.23 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  29.63 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  28.97 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  28.5 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  30.85 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  29.58 
 
 		 220 aa  84.7  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  29.25 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  29.25 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  29.03 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  29.25 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  29.25 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  28.42 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  27.7 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  30.54 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  31.73 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  31.9 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  29.47 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  26.64 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  26.03 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  26.73 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  30.73 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  25.58 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  29.44 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  30.48 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  25 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  29.68 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  28 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  28.63 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  28.65 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  28.65 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  28.11 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  28.11 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  28.65 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  29.19 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>