More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2283 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  100 
 
 
199 aa  416  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  65.83 
 
 
199 aa  280  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  35.58 
 
 
208 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  32.42 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  35.58 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  29.9 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  33.96 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  31.43 
 
 
219 aa  106  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  31.31 
 
 
224 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  30.1 
 
 
206 aa  106  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  34.13 
 
 
215 aa  105  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  33.02 
 
 
220 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  31.79 
 
 
211 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  28.8 
 
 
201 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  34.81 
 
 
214 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  28.8 
 
 
201 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  30.92 
 
 
201 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  34.3 
 
 
215 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  28.27 
 
 
201 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  33.18 
 
 
233 aa  101  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  29.44 
 
 
217 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  32.06 
 
 
200 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  28.93 
 
 
208 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  33.33 
 
 
211 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  31.07 
 
 
223 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  32.29 
 
 
208 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  33.18 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  27.55 
 
 
202 aa  99  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  35.75 
 
 
215 aa  98.6  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  31.72 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  29.79 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  32.38 
 
 
212 aa  95.5  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  30 
 
 
211 aa  95.5  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  30.32 
 
 
218 aa  94  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  34.27 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  27.55 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  28.5 
 
 
237 aa  92.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  27.72 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  28.35 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  29.81 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  27.62 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.38 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  32.52 
 
 
210 aa  89  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  31.75 
 
 
223 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  28.76 
 
 
217 aa  88.6  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  31.75 
 
 
223 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  28.16 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  34.57 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  30.84 
 
 
218 aa  88.6  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  30.92 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.05 
 
 
220 aa  88.2  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  30.54 
 
 
214 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  29.84 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  29.81 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  29.81 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  29.81 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  29.81 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  29.35 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  29.03 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  28.95 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  31.76 
 
 
218 aa  85.9  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  28.04 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  26.94 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  29.81 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  29.81 
 
 
217 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  31.66 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  30.05 
 
 
210 aa  84.7  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  28.9 
 
 
218 aa  84.7  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  29.79 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  25.79 
 
 
200 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  27.18 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  27.85 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  28.99 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  28.99 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  29.7 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  27.23 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  29.7 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  28.86 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.32 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  26.77 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  27.78 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  28.71 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  27.78 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  27.78 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  28.82 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  28.14 
 
 
217 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  27.98 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  28.5 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  24.78 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.59 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  31.71 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  25.26 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  27.78 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  27.72 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  28.95 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  27.27 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.77 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  26.26 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  32.82 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>