223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2199 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  100 
 
 
219 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  53.67 
 
 
218 aa  258  6e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  51.15 
 
 
219 aa  240  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  42.59 
 
 
226 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  41.28 
 
 
227 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  41.2 
 
 
227 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  40.55 
 
 
227 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  40.74 
 
 
227 aa  201  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  43.12 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  40.28 
 
 
226 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  43.12 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  42.2 
 
 
220 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  40.28 
 
 
227 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  40.28 
 
 
227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  40.28 
 
 
227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  40.55 
 
 
223 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  41.4 
 
 
220 aa  177  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  36.32 
 
 
235 aa  161  8.000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  37.5 
 
 
222 aa  154  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  37.5 
 
 
222 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  40.72 
 
 
209 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  42.92 
 
 
209 aa  142  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  39.37 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  38.65 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  34.08 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  35.75 
 
 
208 aa  125  7e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  32.41 
 
 
220 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  42.51 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  33.18 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  33.67 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  33.97 
 
 
216 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  33.66 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  32.11 
 
 
219 aa  106  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  28.7 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  29.86 
 
 
211 aa  91.7  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  28.17 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  28.17 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  28.17 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  30.7 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  27.64 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  29.38 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  30.14 
 
 
208 aa  85.9  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  28.79 
 
 
211 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  27.63 
 
 
218 aa  84.7  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  30.43 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  28.14 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  27.78 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  31.28 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  30.81 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  31.31 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  29.69 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  27.85 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  28.1 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  29.81 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  30.19 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  26.95 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  28.57 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  29.72 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  28.64 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  30.15 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  27.54 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  31.03 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  25.47 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  23.56 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  44.05 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  26.52 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  26.43 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  26.63 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  31.71 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  27.54 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  26.67 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  22.12 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  29.31 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  25.11 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  28.91 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  27.23 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  24.42 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  25.6 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  28.25 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  23.92 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  24.54 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  24.54 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  24.54 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  24.54 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.72 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  26.07 
 
 
200 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  26.58 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  25.44 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  25.81 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  23.56 
 
 
237 aa  62  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  25.44 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  22.64 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25.49 
 
 
183 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0338  nitroreductase family protein  27 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.729008  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  26.47 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  25.25 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  24.24 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl289  DAD(P)H nitroreductase  24.29 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0826737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>