More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1805 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  100 
 
 
199 aa  412  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  43.56 
 
 
206 aa  186  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  37.37 
 
 
206 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  36.68 
 
 
202 aa  139  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  35.9 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  34.87 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  34.87 
 
 
201 aa  127  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  29.9 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  31.16 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  31.03 
 
 
211 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  28.43 
 
 
208 aa  102  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  34.13 
 
 
223 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  31.19 
 
 
208 aa  98.6  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  32.51 
 
 
209 aa  98.6  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  26.02 
 
 
199 aa  94  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.52 
 
 
220 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.92 
 
 
227 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  30.43 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  29.95 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.92 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.95 
 
 
227 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.92 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  29.95 
 
 
227 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  33.49 
 
 
220 aa  88.6  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  29.5 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  29.47 
 
 
227 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  31.22 
 
 
223 aa  88.2  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  31.22 
 
 
223 aa  88.2  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  30.29 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  30.06 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  30.06 
 
 
222 aa  86.3  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  26.4 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.63 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  23.58 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.4 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  25.5 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  25.38 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  25 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  25 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  26.9 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  25 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  25 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  24.5 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  24.5 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  24.5 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  28.16 
 
 
219 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  27.23 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  25.12 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  25.12 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  21.99 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  23.19 
 
 
265 aa  71.6  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  25.25 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  25.25 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  24.75 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  24.75 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  25.25 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  25.25 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  25.81 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  23.15 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  24.75 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  28.89 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  23.67 
 
 
270 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  24.62 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  25.77 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  24.38 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl289  DAD(P)H nitroreductase  27.54 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0826737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  22.63 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  26.7 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  23.88 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  22.82 
 
 
270 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  25.24 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  25.97 
 
 
218 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  24.37 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  25.62 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  26.02 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  27.54 
 
 
219 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  25.13 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  23.03 
 
 
220 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  24.29 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  26.18 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  25.93 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  26.32 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  25.13 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  26.04 
 
 
217 aa  61.6  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  25.79 
 
 
217 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  23.12 
 
 
200 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  25.13 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  25.13 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  25.4 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  25.4 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  26.18 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  22.28 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  25.13 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0189  nitroreductase  23.15 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  25.81 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  21.05 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  23.59 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  20.41 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  23.79 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  21.69 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>