296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0189 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0189  nitroreductase  100 
 
 
203 aa  416  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  45.81 
 
 
200 aa  179  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  29.05 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  29.05 
 
 
212 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  29.05 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  29.05 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  28.1 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  29.7 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  29.21 
 
 
212 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  31.53 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  31.66 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  29.95 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  26.47 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  28.5 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.03 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  28.72 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  28.72 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  28.72 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  28.72 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  28.72 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  28.72 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  28.72 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  28.08 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  28.72 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  28.43 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.24 
 
 
165 aa  72  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  28.21 
 
 
205 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  28.08 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  24.26 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  26.67 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  26.18 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  24.62 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  26.49 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  24.87 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  28.14 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  25.95 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  25.5 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  28.64 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  28.14 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  25.7 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  23.18 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  29.03 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.62 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  26.42 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  25.78 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  26.37 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  25.78 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  25.13 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2826  nitroreductase family protein  28.05 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3040  nitroreductase family protein  28.05 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.66988  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  23.15 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  26.04 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  24.61 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  25.23 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  26.15 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  25.33 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  25 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  24.75 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  22.57 
 
 
217 aa  58.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  24.04 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  24.32 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  23.3 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  40.35 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  24.63 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  27.18 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  24.53 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  25.13 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  19.67 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  24.53 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  21.18 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  24.53 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  23.33 
 
 
202 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  24.53 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  24.53 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  24.53 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  25.79 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.4 
 
 
220 aa  55.1  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  23.32 
 
 
217 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  26.76 
 
 
217 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  24.88 
 
 
217 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  29.07 
 
 
200 aa  54.7  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  28.5 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  20.96 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  25.41 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  26.42 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  26.57 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  27.59 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  19.13 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  27.18 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  23.14 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  21.03 
 
 
270 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  37.11 
 
 
166 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  23.14 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  26.29 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  24.02 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>