More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1646 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  100 
 
 		 200 aa  417  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  59.5 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  56.5 
 
 		 200 aa  247  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  56 
 
 		 202 aa  245  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  56 
 
 		 200 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  54.5 
 
 		 200 aa  235  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  52.5 
 
 		 202 aa  231  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  50.5 
 
 		 200 aa  221  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  51 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  49.5 
 
 		 199 aa  214  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  49.5 
 
 		 200 aa  214  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  48 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  45.5 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  46 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  44 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  41.12 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  31.94 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  32.26 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  35.96 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  30.98 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  29.26 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  32.8 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  31.77 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  32.2 
 
 		 213 aa  97.8  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  27.98 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  27.98 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  27.98 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  27.98 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  27.98 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  27.98 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  27.98 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  27.46 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  27.46 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  30 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  27.92 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  31.94 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  28.43 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  29.29 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  31.15 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  29.17 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  29.29 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  28.79 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  27.89 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  28.28 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  28.28 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  28.28 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  28.28 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  29.47 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  31.1 
 
 		 221 aa  88.2  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  28.27 
 
 		 212 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  26.46 
 
 		 203 aa  87.8  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  28.27 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  28.27 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  28.8 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  26.49 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  27.75 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  27.36 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  27.75 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.16 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  31.44 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  31.38 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  28.22 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0456  nitroreductase  26.45 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  27.69 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  29.65 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  28.27 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.11 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  30.41 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  29.82 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.65 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.65 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  28.06 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.15 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  27.32 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  26.92 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  27.37 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  27.75 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  29.15 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  30.81 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  26.32 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  28.74 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  28.74 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  28.22 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.84 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  26.7 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.67 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  28.74 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  26.04 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  29.34 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  25.27 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  29.38 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  25.62 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  26.83 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  28.5 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  26.51 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.84 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  29.38 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  29.14 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>