247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0821 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  100 
 
 		 242 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  31.42 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  30.97 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  28.39 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0456  nitroreductase  30.73 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  30.13 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  31.88 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  30 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1678  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.77 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.244515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  30.77 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  25.68 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  25.68 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  25.68 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  25.68 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  25.68 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05892  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.92 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  25.11 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  27.57 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  25.68 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  25.88 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  29.26 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  26.98 
 
 		 200 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  28.19 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  25.21 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  25.7 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  25.65 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  26.67 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  27.88 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  28.1 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  28.92 
 
 		 200 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28.5 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  28.64 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  27.94 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  27.43 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  27.85 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  30.62 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  28.18 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  28.92 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  28.22 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  27.54 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  27.4 
 
 		 200 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.64 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  28.64 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  27.14 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  25.93 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  30.84 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  23.38 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  27.08 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  24.46 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  24.54 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.03 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  23.63 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  22.69 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  23.63 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  23.63 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  23.38 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  24.05 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47329  predicted protein  29.31 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  24.05 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  22.94 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  25.49 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  23.61 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  24.05 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  24.07 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  24.07 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  24.07 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  25 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  23.38 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  22.94 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  25.23 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  24.66 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  22.94 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  22.94 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  22.94 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  25.82 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  25.37 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  25.93 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  25.36 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  40 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  25.71 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  27.86 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  40 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  28.96 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  24.51 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  26.82 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  25.46 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  26.24 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  38.57 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.21 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  21.36 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  38.57 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  22.77 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.79 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  22.77 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  25.94 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  25 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  24.26 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  28.84 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  26.87 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  25.31 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>