252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2077 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  94.93 
 
 		 217 aa  430  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  94.93 
 
 		 217 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  90.32 
 
 		 217 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  65.44 
 
 		 217 aa  278  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  65.9 
 
 		 216 aa  275  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  55.35 
 
 		 217 aa  265  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  55.3 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  56.07 
 
 		 217 aa  259  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  56.07 
 
 		 217 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  55.61 
 
 		 217 aa  257  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  54.42 
 
 		 217 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  54.42 
 
 		 217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  57.14 
 
 		 220 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  54.42 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  54.67 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  54.67 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  53.49 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  53.49 
 
 		 217 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  53.02 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  53.02 
 
 		 217 aa  245  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  53.02 
 
 		 217 aa  245  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  53.02 
 
 		 217 aa  245  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  53.02 
 
 		 217 aa  245  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  51.9 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  51.9 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  52.56 
 
 		 217 aa  244  8e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  50.93 
 
 		 217 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  50.93 
 
 		 217 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  52.56 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  52.56 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  52.56 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  52.09 
 
 		 216 aa  240  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  58.1 
 
 		 217 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  54.76 
 
 		 217 aa  237  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  56.74 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  55.56 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  47.93 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  48.06 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  37.56 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  36.97 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  38.14 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  37.2 
 
 		 218 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  34.11 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  36.28 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  35.89 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  33.17 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  32.24 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  32.72 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  32.43 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  31.58 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  29.33 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  33.63 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  29.95 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  32.71 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  33.79 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  33.66 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  33 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  27.09 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  30.58 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  33.18 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  32.13 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  32.27 
 
 		 200 aa  95.5  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.61 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  26.98 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  30.84 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  32.16 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  31.5 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  34.16 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  31.71 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  27.83 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  30.26 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  29.5 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  27.23 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  26.8 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  30.2 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  30.21 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.21 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  29.1 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  30.14 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  26.05 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  31.9 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  27.86 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  29.7 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  28.22 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  26.73 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  31.28 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  30.23 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  28.02 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  30.72 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  28.16 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  27.08 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  25.35 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  26.53 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  24.22 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  28.5 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  27.09 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>