203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3051 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  100 
 
 		 217 aa  448  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  99.54 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  99.08 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  99.08 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  98.62 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  98.62 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  98.62 
 
 		 217 aa  443  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  98.16 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  98.62 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  88.48 
 
 		 217 aa  400  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  88.02 
 
 		 217 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  88.48 
 
 		 217 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  87.1 
 
 		 217 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  84.79 
 
 		 217 aa  381  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  57.6 
 
 		 217 aa  277  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  58.06 
 
 		 217 aa  275  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  55.09 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  55.09 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  54.63 
 
 		 217 aa  247  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  54.63 
 
 		 217 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  52.56 
 
 		 217 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  52.56 
 
 		 217 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  51.85 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  51.85 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  54.29 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  51.85 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  51.85 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  54.17 
 
 		 217 aa  241  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  52.09 
 
 		 217 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  56.46 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  51.4 
 
 		 218 aa  237  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  52.09 
 
 		 217 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  57.42 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  56.46 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  53.02 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  45.16 
 
 		 216 aa  218  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  50.23 
 
 		 217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  47.44 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  47 
 
 		 216 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  38.32 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  38.16 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  35.65 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  36.71 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  35.27 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  32.87 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  33.18 
 
 		 237 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  35.35 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  30.84 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  30.92 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  33.17 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  32.52 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  33.49 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  30.1 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  28.64 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  30.48 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  29.26 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  28.97 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  28.43 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  29.5 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  27.98 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  25.84 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  26.34 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  30 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  28.5 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.4 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  25.11 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  27.08 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  25.58 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  28.43 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  26.98 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  25.12 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  30.09 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.5 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.28 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.5 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  29.55 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  27.14 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  29 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  28.28 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  26.64 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  26.85 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  27.14 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  25.84 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  31.72 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  31.72 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  25.46 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.81 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  29.55 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  28.08 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  27.94 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  29.12 
 
 		 258 aa  64.7  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  24.22 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  25.82 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  30.85 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  27.18 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  28.32 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  26.39 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  25.93 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  24.88 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  25.84 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>