250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0778 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  100 
 
 
220 aa  460  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  53.95 
 
 
220 aa  236  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  49.32 
 
 
226 aa  221  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  48.42 
 
 
227 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  47.96 
 
 
227 aa  218  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  47.73 
 
 
227 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  47.73 
 
 
227 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  47.73 
 
 
227 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  47.73 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  46.61 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  48.62 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  48.13 
 
 
223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  48.13 
 
 
223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  48.87 
 
 
223 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  46.15 
 
 
227 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  46.36 
 
 
224 aa  198  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  42.59 
 
 
218 aa  191  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  41.89 
 
 
235 aa  171  7.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  38.01 
 
 
222 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  38.01 
 
 
222 aa  161  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  41.4 
 
 
219 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  39.07 
 
 
208 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  38.43 
 
 
211 aa  152  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  39.15 
 
 
209 aa  149  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  41.51 
 
 
206 aa  142  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  39.25 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  37.98 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  35.71 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  35.71 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  31.84 
 
 
218 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  33.17 
 
 
216 aa  115  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  33.98 
 
 
219 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  30.48 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  32.68 
 
 
215 aa  108  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  32.67 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  32.08 
 
 
201 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  29.19 
 
 
215 aa  106  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  32.08 
 
 
201 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  31.8 
 
 
217 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  31.6 
 
 
201 aa  104  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  30.8 
 
 
217 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  31.8 
 
 
217 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  30.8 
 
 
217 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  31.34 
 
 
217 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  29.95 
 
 
206 aa  103  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  32.69 
 
 
206 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  30.88 
 
 
217 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  30.88 
 
 
217 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  30.88 
 
 
217 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  31.98 
 
 
218 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  30.88 
 
 
217 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  31.65 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  34.74 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  30.92 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  32.21 
 
 
216 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  30.26 
 
 
224 aa  95.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  32 
 
 
217 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  32 
 
 
217 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  35.19 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  28.64 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  31.56 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  29.86 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  31.58 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  30.95 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  31.71 
 
 
217 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  33.49 
 
 
199 aa  88.6  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  30.95 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  30.95 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  30.95 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  32.2 
 
 
217 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  31.67 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  32.09 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  31.11 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  28.85 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  30.48 
 
 
217 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  30.48 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  33.5 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  32.2 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  32.49 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  29.28 
 
 
220 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112845 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  30.48 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  28.37 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  30.48 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  29.6 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.97 
 
 
206 aa  84.7  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  27.59 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  28.18 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  27.75 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  29.07 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  27.88 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  25 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  33.14 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  28.25 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  30.41 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  31.68 
 
 
199 aa  82  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  27.4 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  27.4 
 
 
212 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  27.36 
 
 
202 aa  82  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  27.4 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  30.48 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>