183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2772 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  37.38 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  40.8 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  36.1 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  37.32 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  32.86 
 
 		 211 aa  134  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  30.66 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  35.05 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  38.92 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  33.66 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  30.92 
 
 		 210 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  30.95 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  31.34 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  32.21 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  32.21 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  32.69 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  30.66 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  30.69 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  36.92 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  32.52 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  32.21 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  31.71 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  27.04 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  29.13 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  30.69 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  30.19 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  31.31 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  27.32 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.31 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  28.02 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  28.02 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  26.64 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  31.63 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  26.05 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.97 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  27.64 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  27.64 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.64 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.64 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  29.94 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  27.86 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  28.06 
 
 		 199 aa  95.5  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.64 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  27.91 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  25.58 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  30.26 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  28.11 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  26.54 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  26.64 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  28.3 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  26.85 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  26.09 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  26.85 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  27.05 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  27.05 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  28.64 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  25.91 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  26.85 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  27.62 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  25.93 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  29.11 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  26.92 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  27.23 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  27.23 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  27.78 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 		 217 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  26.98 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  27.74 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  27.23 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  27.09 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  28.23 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  26.21 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  27.05 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  26.9 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl289  DAD(P)H nitroreductase  31.79 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0826737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  28 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  29.02 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  25.6 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  25.42 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  26.4 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  25.13 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  26.79 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  26.13 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.27 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  25.25 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  25.25 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  28.5 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  30.85 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  25.25 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  24.64 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  25.25 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  26.19 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  28.16 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  28.5 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  25.84 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  22.45 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  24.88 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  25.84 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  25.84 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  25.84 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>