More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0920 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  52 
 
 
201 aa  228  5e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  52 
 
 
201 aa  226  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  51 
 
 
201 aa  224  6e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  36.68 
 
 
199 aa  139  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  35.64 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  34.16 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  32.37 
 
 
206 aa  122  5e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  32.41 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  28.5 
 
 
211 aa  112  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  29.47 
 
 
209 aa  112  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  31.94 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  30.48 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  33.33 
 
 
209 aa  104  9e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  29.19 
 
 
215 aa  103  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  31.94 
 
 
223 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  32.52 
 
 
224 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  31.98 
 
 
227 aa  99  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  27.55 
 
 
199 aa  99  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  32.52 
 
 
206 aa  97.8  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  31.79 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  31.79 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  31.47 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  29.95 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.77 
 
 
227 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.77 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.77 
 
 
227 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  31 
 
 
226 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.5 
 
 
227 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  28.86 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  31.73 
 
 
212 aa  92.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  27.66 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  30.77 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.18 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  30.77 
 
 
212 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  30.77 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  31.37 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  25.51 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  30.29 
 
 
212 aa  87.8  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.02 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  30.29 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  30.41 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  30.39 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  26.78 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  28.08 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  29.02 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.5 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  29.23 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  26.13 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  29.38 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  29.38 
 
 
205 aa  82  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  29.38 
 
 
205 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  29.38 
 
 
205 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  29.38 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  28.26 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.24 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  28.87 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  28.87 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  25.13 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  22.28 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  24.15 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  26.21 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  27.72 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  28.02 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  28.06 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  27.83 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  26.21 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.8 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  29.17 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.53 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.79 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.67 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  27.17 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.24 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  26.06 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  26.37 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  26.24 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  26.87 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  25.68 
 
 
175 aa  72  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  27.37 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.32 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.17 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  25 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  24.04 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  23.26 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  24.86 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  27.09 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  24.55 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  27.1 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  22.98 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  24.38 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  29.14 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  24.39 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  25.24 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  25.36 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  26.64 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  23.39 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  25.38 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  25.38 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>