More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0857 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  100 
 
 
175 aa  360  6e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  64.57 
 
 
175 aa  234  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  60 
 
 
175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  54.86 
 
 
175 aa  197  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  58.29 
 
 
175 aa  186  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  46.26 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  44.59 
 
 
192 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  48.21 
 
 
173 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  39.77 
 
 
170 aa  119  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  38.04 
 
 
174 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  35.06 
 
 
178 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  33.9 
 
 
176 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.8 
 
 
184 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  44.17 
 
 
174 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  34.3 
 
 
176 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  32.63 
 
 
186 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  34.1 
 
 
215 aa  98.6  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  31.4 
 
 
329 aa  97.8  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  35.48 
 
 
179 aa  95.9  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  34.97 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  32.54 
 
 
214 aa  92.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  29.71 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.68 
 
 
176 aa  91.3  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  34.52 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  32.61 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.94 
 
 
180 aa  89  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  30.29 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32.34 
 
 
168 aa  89  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  35.88 
 
 
170 aa  87.8  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.32 
 
 
186 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  29.14 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  32.34 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  31.82 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  28 
 
 
171 aa  84.7  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  28 
 
 
171 aa  84.7  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.07 
 
 
165 aa  84.3  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  34.27 
 
 
163 aa  84.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  30.95 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  31.54 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  30.54 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30.06 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  32.28 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  31.14 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.85 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  29.94 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  30.81 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  30.57 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  26.59 
 
 
202 aa  80.9  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  32.2 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  28.34 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.65 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  31.51 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27.06 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  28.14 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  32.22 
 
 
242 aa  77  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.52 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  32.74 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  31.64 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  30.29 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  27.17 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.93 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  31.25 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  26.8 
 
 
221 aa  73.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.16 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  29.93 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  27.33 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  28.49 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.14 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  26.09 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  27.87 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.4 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  26.52 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  24.74 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  30.34 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.28 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.17 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  27.87 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.4 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.38 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  29.71 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  26.82 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  32 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  30.53 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  26.6 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  27.81 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.68 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  23.61 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  30.53 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  33.11 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  30.35 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.08 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  26.19 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  30.56 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.06 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.1 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  24.86 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  30.97 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  24.86 
 
 
201 aa  67.4  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.57 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>