220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10128 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  100 
 
 		 210 aa  433  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  67.31 
 
 		 211 aa  292  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  63.59 
 
 		 233 aa  290  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  67.32 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  62.2 
 
 		 212 aa  277  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  61.06 
 
 		 211 aa  263  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  57 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  55.56 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  58.37 
 
 		 209 aa  218  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  53.11 
 
 		 216 aa  205  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  47.32 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  43.96 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  41.9 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  37.13 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  33.66 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  35.44 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  37.38 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  35.75 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  37.02 
 
 		 210 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  32.06 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  33.65 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  32.86 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  32.97 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  34.08 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  34.08 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  33.98 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  33.63 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  34.21 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  34.08 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  35.23 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  30.59 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  32.86 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  31.43 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  30 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  32.28 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  32.11 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  29.68 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  29.86 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.36 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.36 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.36 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  26.87 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  29.15 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.84 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  31.58 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.11 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  31.58 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  25.62 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  30.05 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  27.59 
 
 		 227 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  28.96 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  28.08 
 
 		 227 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  31.07 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  29.95 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  26.61 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  30.45 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  30.62 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  32.13 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  30.17 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  35.24 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  30.14 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  29.59 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  29.59 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  29.35 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  29.95 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  31.1 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  29.19 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  30.41 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  29.41 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  29.35 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  30.19 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  29.09 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  29.86 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  26.06 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  28.71 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  28.71 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  28.71 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  28.71 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  30.92 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  29.03 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  26.85 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  32.63 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  26.32 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  29.67 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  27.83 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  27.83 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  28.12 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  27.41 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  28.7 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  26.27 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  27.36 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  26.98 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  26.89 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  25.93 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  25.93 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  28.57 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  25.93 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  26.89 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  26.09 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  29.21 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>