More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0153 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  43.1 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  40.96 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  43.24 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  42.86 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  38.04 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  35.26 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  34.16 
 
 		 163 aa  101  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  36.2 
 
 		 175 aa  101  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  30.99 
 
 		 329 aa  97.8  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  34.15 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.86 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  32.14 
 
 		 176 aa  94.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.41 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  32.64 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  31.93 
 
 		 163 aa  92.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  33.93 
 
 		 167 aa  90.9  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  35.09 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30.99 
 
 		 168 aa  89.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.32 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  31.4 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.65 
 
 		 204 aa  88.6  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  34.5 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  30.99 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  32.02 
 
 		 183 aa  85.1  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  30.72 
 
 		 175 aa  85.1  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  33.14 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  33.33 
 
 		 173 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  33.33 
 
 		 184 aa  84.7  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  30 
 
 		 215 aa  84.3  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.9 
 
 		 176 aa  84.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  34.64 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  32.34 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  36 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  31.74 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.54 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  30.54 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  40.34 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  31.14 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  31.14 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.34 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  32.07 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  34.19 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  29.59 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  29.8 
 
 		 350 aa  80.9  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  29.45 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  29.45 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  34.44 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30.18 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  29.45 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  31.74 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.38 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  28.22 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.03 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  30.96 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  32.34 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  30.96 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3158  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.39 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  33.33 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  31.93 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  33.33 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  33.14 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  30.34 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  31.28 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.25 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  26.53 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  31.14 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.32 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  31.06 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.65 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  32.26 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  29.12 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.8 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  31.48 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  27.81 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  30.43 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  31.29 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  27.22 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1657  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.89 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.23 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.49 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  27.11 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.06 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  23.9 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.11 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  35.26 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  25.73 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  26.37 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.44 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.9 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.31 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.4 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.9 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.31 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.34 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.84 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3917  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.31 
 
 		 248 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  28.4 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  30.06 
 
 		 368 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.46 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>