More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1448 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  100 
 
 
170 aa  347  4e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  56.36 
 
 
168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  55.56 
 
 
176 aa  191  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  48.52 
 
 
163 aa  167  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  47.4 
 
 
194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  44.02 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  46.24 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  46.82 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  43.48 
 
 
186 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  44.51 
 
 
178 aa  154  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  43.01 
 
 
188 aa  151  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  40.22 
 
 
186 aa  147  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  41.3 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  46.11 
 
 
174 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  40.8 
 
 
176 aa  142  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  44.91 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  39.88 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  42.46 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  35.68 
 
 
204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  45.68 
 
 
192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  41.34 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  40.96 
 
 
174 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  44.64 
 
 
166 aa  122  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  43.27 
 
 
173 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  39.41 
 
 
178 aa  121  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  44.64 
 
 
166 aa  120  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  41.98 
 
 
278 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  40.24 
 
 
178 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  42.01 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  37.5 
 
 
184 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  38.1 
 
 
181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  37.43 
 
 
175 aa  114  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  38.27 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  38.41 
 
 
163 aa  112  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  39.77 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  32.76 
 
 
170 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  38.96 
 
 
169 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  34.88 
 
 
166 aa  108  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  34.12 
 
 
176 aa  108  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  36.69 
 
 
175 aa  107  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  33.95 
 
 
171 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  35.29 
 
 
173 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  36.47 
 
 
173 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  38.01 
 
 
173 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  36.47 
 
 
167 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  38.33 
 
 
181 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  38.33 
 
 
181 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  36.48 
 
 
175 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  38.31 
 
 
171 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  36.24 
 
 
171 aa  104  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  37.43 
 
 
173 aa  104  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  33.53 
 
 
180 aa  104  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  34.92 
 
 
190 aa  103  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  35.29 
 
 
176 aa  103  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  33.13 
 
 
175 aa  103  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  36.65 
 
 
174 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  33.53 
 
 
167 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  36.32 
 
 
187 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  33.91 
 
 
180 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  34.48 
 
 
174 aa  100  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  34.64 
 
 
172 aa  100  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  32.34 
 
 
215 aa  99.4  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  34.88 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  37.43 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  29.71 
 
 
253 aa  99  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  32.49 
 
 
208 aa  98.2  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  33.53 
 
 
329 aa  97.1  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  30 
 
 
188 aa  97.4  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  32.96 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  32.94 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  33.52 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  38.67 
 
 
166 aa  96.7  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  31.58 
 
 
177 aa  95.5  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  33.33 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  33.33 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.16 
 
 
191 aa  95.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  35.58 
 
 
169 aa  95.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  36.36 
 
 
172 aa  94.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  31.46 
 
 
240 aa  94.7  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.16 
 
 
214 aa  94.4  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  34.68 
 
 
170 aa  94.4  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  35.62 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  36.78 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  32.3 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  36 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  31.28 
 
 
257 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  37.74 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  30.54 
 
 
214 aa  92.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  33.95 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  33.54 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  35.23 
 
 
190 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  32.12 
 
 
170 aa  91.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  35 
 
 
173 aa  91.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  30.58 
 
 
221 aa  91.3  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  36 
 
 
169 aa  90.9  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  31.68 
 
 
187 aa  91.3  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  38.71 
 
 
175 aa  90.9  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  28.81 
 
 
261 aa  90.9  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  34.57 
 
 
176 aa  90.9  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  33.55 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>