More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0709 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  81.25 
 
 
214 aa  354  5.999999999999999e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  59.79 
 
 
329 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  38.69 
 
 
173 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  32.34 
 
 
170 aa  99.4  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  31.95 
 
 
175 aa  94.7  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  33.73 
 
 
175 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  33.91 
 
 
175 aa  94.4  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.12 
 
 
192 aa  93.2  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.34 
 
 
174 aa  92.4  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.71 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  31.76 
 
 
176 aa  89.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  31.21 
 
 
175 aa  89.4  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.57 
 
 
194 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.64 
 
 
176 aa  85.5  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  35.22 
 
 
174 aa  85.1  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.14 
 
 
178 aa  85.1  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  32.16 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  30 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.93 
 
 
163 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.43 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.12 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.52 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29.65 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  34.03 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.86 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  27.62 
 
 
317 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  32.57 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.65 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  29.73 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  27.93 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.47 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  31.21 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  34.9 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  31.79 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  31.07 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.53 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.32 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.65 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.32 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  32.37 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  29.65 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  30 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  28.99 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.51 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.48 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.42 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  27.53 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  29.32 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  26.55 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25 
 
 
165 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  30.92 
 
 
171 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  30.29 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.48 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  28.74 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  29.52 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  30.11 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  26.11 
 
 
350 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  29.41 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  27.27 
 
 
173 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  31.28 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  31.51 
 
 
166 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  27.37 
 
 
169 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  31.07 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  26.79 
 
 
173 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.75 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.06 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.06 
 
 
191 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  28.32 
 
 
181 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  25.71 
 
 
274 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  26.59 
 
 
240 aa  62  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.88 
 
 
184 aa  62  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  28.65 
 
 
170 aa  61.6  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.65 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  31.4 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  27.33 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  25 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.17 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.48 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  30.56 
 
 
273 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  29.17 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  30.51 
 
 
288 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.81 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  28.66 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  24.58 
 
 
316 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.81 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  29.03 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  25.14 
 
 
169 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  29.63 
 
 
171 aa  58.9  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  27.5 
 
 
176 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  26.44 
 
 
282 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 
285 aa  58.5  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  22.61 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  24.7 
 
 
180 aa  58.5  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.54 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  27.22 
 
 
273 aa  58.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
171 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
171 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.54 
 
 
174 aa  58.2  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>