More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0221 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  100 
 
 
180 aa  371  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  63.37 
 
 
177 aa  236  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  52.73 
 
 
167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  48.48 
 
 
167 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  47.95 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  45.73 
 
 
170 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  47.95 
 
 
174 aa  158  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  46.82 
 
 
177 aa  147  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  47.62 
 
 
172 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  47.77 
 
 
178 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.53 
 
 
170 aa  104  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.36 
 
 
165 aa  100  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  36.9 
 
 
166 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  32.19 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  31.29 
 
 
169 aa  97.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  34.34 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  33.56 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  34.52 
 
 
167 aa  95.5  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  32.93 
 
 
171 aa  95.9  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  32.2 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  36.24 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  32.57 
 
 
174 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  31.28 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.51 
 
 
186 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  28.64 
 
 
212 aa  92.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  29.78 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  32.05 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.11 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.72 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  33.11 
 
 
166 aa  91.3  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  33.13 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  35.1 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  31.13 
 
 
173 aa  89  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  30.41 
 
 
169 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  31.06 
 
 
169 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.18 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  30.46 
 
 
173 aa  87.8  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.88 
 
 
174 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  29.63 
 
 
169 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  32.93 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.89 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  32.62 
 
 
202 aa  85.1  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  29.8 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  31.03 
 
 
171 aa  84.7  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  31.03 
 
 
171 aa  84.7  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  24.88 
 
 
213 aa  84.3  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  32.48 
 
 
274 aa  84  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  33.13 
 
 
169 aa  84.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  31.71 
 
 
169 aa  84.3  9e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  29.19 
 
 
246 aa  84  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.17 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.32 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.71 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.42 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  34.18 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.14 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.67 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  29.34 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  29.94 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  28.02 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.88 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  28.76 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  33.97 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.67 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.11 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  25.64 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.94 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  29.93 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  29.74 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.34 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.94 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.5 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  25.97 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  29.28 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  27.38 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  26.32 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  30.99 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  28.25 
 
 
240 aa  74.7  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  30.36 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  32.24 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  30.11 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  27.92 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  27.92 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  27.92 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  27.69 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  27.92 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  27.92 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  27.88 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  27.92 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  27.92 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  29.07 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  31.35 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  28.64 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  30.6 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  31.29 
 
 
181 aa  72  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  29.53 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  26.37 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  26.51 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>