More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1294 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  100 
 
 		 167 aa  345  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  46.67 
 
 		 171 aa  160  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  43.71 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  37.72 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  36.53 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  36.53 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  40.24 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  40.24 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  41.46 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  35.5 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  34.91 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  41.92 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  34.32 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  36.36 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  36.53 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  34.15 
 
 		 169 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  32.93 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  39.6 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  34.32 
 
 		 197 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  36.36 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  33.92 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  36.53 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  36.53 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  38.41 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  35.29 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  35.29 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  35.98 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  35.33 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  35.33 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  39.39 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  33.54 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  33.91 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  34.52 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  34.91 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  32.34 
 
 		 274 aa  92  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  32.88 
 
 		 167 aa  91.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  34.23 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  29.52 
 
 		 176 aa  90.5  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  33.72 
 
 		 172 aa  90.5  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.41 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  32.74 
 
 		 172 aa  87.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.21 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  33.77 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  34.78 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  33.33 
 
 		 176 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  31.55 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.67 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  33.11 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  27.98 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  34.72 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.46 
 
 		 178 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.58 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.95 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  31.76 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.11 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.65 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.27 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  29.21 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.65 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.8 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30.41 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  31.06 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.53 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.59 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  27.71 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  34.12 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  29.82 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  31.37 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  30.95 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  26.71 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  28.82 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25.88 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.3 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.19 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.36 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  27.11 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  30.18 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  30.93 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  30.97 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  28.99 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0704  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.53 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  28.19 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.47 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3917  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.57 
 
 		 248 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.47 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  29.86 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.67 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.57 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0721  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.02 
 
 		 249 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0629951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.97 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.5 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.31 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.05 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.05 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.05 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  29.11 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  32 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  28.41 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.85 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  30.06 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>