More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0694 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  100 
 
 
183 aa  382  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  39.25 
 
 
191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  37.82 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  37.97 
 
 
189 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  39.52 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  39.52 
 
 
188 aa  127  9.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  41.18 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  40.12 
 
 
188 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  35.67 
 
 
196 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  31.91 
 
 
186 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  33.33 
 
 
192 aa  104  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  31.79 
 
 
194 aa  104  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  31.61 
 
 
189 aa  104  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  32.12 
 
 
189 aa  104  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  30.69 
 
 
202 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  30.57 
 
 
189 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  30.46 
 
 
191 aa  101  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  30.64 
 
 
214 aa  101  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  33.93 
 
 
184 aa  98.6  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  31.72 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  34.91 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.81 
 
 
176 aa  88.2  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.22 
 
 
170 aa  88.2  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  28.5 
 
 
334 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.48 
 
 
163 aa  87  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  31.82 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  32.14 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  28.76 
 
 
171 aa  85.1  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2018  nitroreductase  33.52 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  32.5 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  29.17 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  31.61 
 
 
274 aa  82  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  30.72 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.44 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  28.42 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  30.49 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  33.69 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.65 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.82 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.09 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27.62 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  33.93 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  29.38 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30.27 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  28.98 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  29.57 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  27.17 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  35.48 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  31.78 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  31.78 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.96 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.27 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  28.65 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.1 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  29.31 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  22.86 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  29.31 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.25 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  27.95 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  29.31 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  29.31 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.89 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  29.31 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  29.31 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  35.29 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.12 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  29.31 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  28.48 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1363  nitroreductase  30.59 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.42 
 
 
168 aa  72  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  32.9 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  29.14 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  29.31 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.66 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.57 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.39 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.3 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  27.98 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  27.78 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  28.49 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  31.03 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.61 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.33 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  23.08 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  26.09 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.14 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  27.72 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  24.44 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  24.76 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  30 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  26.98 
 
 
348 aa  68.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  28.48 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  32.26 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  24.86 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  28.86 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  29.23 
 
 
275 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  28.32 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  25.73 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  29.89 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  23.67 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>