More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0586 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  391  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  80.85 
 
 
188 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  81.38 
 
 
188 aa  300  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  62.9 
 
 
189 aa  266  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  38.76 
 
 
191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  40.8 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  36.96 
 
 
196 aa  125  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  35.26 
 
 
202 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  39.89 
 
 
186 aa  122  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  37.84 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  36.98 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  35.96 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  34.25 
 
 
194 aa  118  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  35.42 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  36.99 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  36.57 
 
 
192 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  31.55 
 
 
188 aa  108  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  32.18 
 
 
190 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.51 
 
 
191 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.51 
 
 
214 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  34.93 
 
 
185 aa  94.7  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  32.2 
 
 
171 aa  94.4  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  31.67 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  32.58 
 
 
169 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.39 
 
 
345 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  31.58 
 
 
166 aa  89.4  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.82 
 
 
163 aa  89  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  32.16 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  31.33 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  31.14 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.07 
 
 
178 aa  85.1  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  29.48 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  35.77 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  31.49 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.12 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  33.13 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  31.64 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  26.9 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.27 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  26.92 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.83 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  31.98 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  32.8 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  27.81 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  25.41 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  27.22 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  28.65 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  28.65 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  27.43 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.49 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  28.5 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  32.57 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  26.59 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  29.35 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.03 
 
 
177 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  27.53 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2018  nitroreductase  30.56 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.65 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.99 
 
 
180 aa  72  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30.81 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  31.77 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.17 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  28.65 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  29.17 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  27.66 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  24.4 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.81 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  27.74 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.34 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  27.04 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  25.93 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.99 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.77 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  30.16 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  26.26 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.37 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  25.42 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  25 
 
 
273 aa  68.2  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  26.7 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  24.29 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  26.44 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  25.29 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  33.08 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  28.65 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  26.29 
 
 
169 aa  67  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  27.98 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  29.19 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  25.53 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  28.07 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.31 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  27.07 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  23.73 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  25.67 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25 
 
 
334 aa  64.7  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  27.01 
 
 
275 aa  64.7  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  26.38 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.42 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  25.6 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  27.43 
 
 
169 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  30.41 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>