296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1649 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  100 
 
 		 274 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  52.01 
 
 		 273 aa  295  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  45.26 
 
 		 274 aa  268  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  41.24 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  45.09 
 
 		 275 aa  238  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  41.39 
 
 		 275 aa  232  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  40.36 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  38.21 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  40.15 
 
 		 263 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  39.42 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  41.24 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  38.69 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  36.13 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  39.29 
 
 		 273 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  37.68 
 
 		 274 aa  201  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  35.97 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  37.5 
 
 		 272 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  38.35 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  37.59 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  38.32 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  34.06 
 
 		 274 aa  175  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  32.59 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  34.44 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  33.58 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  32.45 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  35.29 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  31.7 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  32.84 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  35.56 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  34.19 
 
 		 273 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  30.48 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  28.25 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  26.5 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  29.23 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  29.82 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  26.86 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  26.41 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  32.35 
 
 		 263 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.36 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  29.74 
 
 		 196 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.17 
 
 		 187 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  26.76 
 
 		 303 aa  92.8  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25.71 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  26.62 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  28.04 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.84 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  30.11 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.41 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  32.35 
 
 		 214 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  32.35 
 
 		 191 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.34 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25.39 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.26 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  30.77 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  28.07 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  24.85 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  27.98 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.42 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  26.59 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  29.08 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.91 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  25.82 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  30.77 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  26.29 
 
 		 172 aa  67  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  27.08 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.74 
 
 		 176 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.44 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.59 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  26.97 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  26.42 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  29.59 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  26.99 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.89 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  27.64 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  25.77 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.12 
 
 		 186 aa  62  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  26.06 
 
 		 176 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  25.64 
 
 		 189 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.87 
 
 		 166 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  24.35 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.16 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  25.86 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.2 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  26.73 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  25.76 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  28.28 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  25.14 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  27.57 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.53 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  27.14 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  26.6 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  25.54 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.63 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  25 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.71 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  27.04 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  28.33 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  26.32 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  24.23 
 
 		 184 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>