188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0015 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  100 
 
 
272 aa  558  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  62.5 
 
 
272 aa  374  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  61.4 
 
 
273 aa  364  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  49.27 
 
 
272 aa  292  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  46.57 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  45.99 
 
 
274 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  47.45 
 
 
282 aa  250  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  42.75 
 
 
274 aa  248  5e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  40.36 
 
 
274 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  40.88 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  41.91 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  42.7 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  41.52 
 
 
274 aa  199  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  37.73 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  33.46 
 
 
275 aa  191  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  39.93 
 
 
263 aa  188  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  37.23 
 
 
274 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  37.36 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  36.13 
 
 
274 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  32.35 
 
 
277 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  34.64 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  34.19 
 
 
262 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  32.34 
 
 
265 aa  148  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  32.25 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  34.75 
 
 
295 aa  145  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  32.58 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  32 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  29.26 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  29.52 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  30.62 
 
 
274 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  31.97 
 
 
273 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  27.61 
 
 
275 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  25.35 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  24.91 
 
 
273 aa  92  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  22.65 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  23.67 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  25.75 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  23.57 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  24.75 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.52 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  25.45 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.48 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  26.32 
 
 
191 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  21.82 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.09 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  26.22 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.17 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.42 
 
 
202 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.52 
 
 
187 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.76 
 
 
174 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.84 
 
 
190 aa  62.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.79 
 
 
165 aa  62.4  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  26.21 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.05 
 
 
166 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  27.17 
 
 
185 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  26.21 
 
 
215 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.4 
 
 
215 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  28.26 
 
 
180 aa  58.9  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  26.21 
 
 
215 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  26.21 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  25.24 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  25.24 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  25.77 
 
 
178 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  25.24 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  25.24 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  24.57 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.23 
 
 
176 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  41.18 
 
 
171 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.01 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25.24 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.75 
 
 
278 aa  55.8  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  28.14 
 
 
184 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.43 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
183 aa  53.9  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.23 
 
 
170 aa  53.9  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  26.16 
 
 
188 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  24.32 
 
 
186 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.43 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.55 
 
 
178 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  28.72 
 
 
184 aa  53.5  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  23.6 
 
 
163 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  25.12 
 
 
252 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  26.78 
 
 
178 aa  52.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.78 
 
 
194 aa  52.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.92 
 
 
194 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  24.71 
 
 
192 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  51.72 
 
 
172 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.13 
 
 
190 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.51 
 
 
386 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.35 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  27.47 
 
 
181 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  36.78 
 
 
178 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  32.98 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  25.54 
 
 
173 aa  49.7  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  27.59 
 
 
189 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  22.84 
 
 
215 aa  49.7  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  44.07 
 
 
232 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  24.43 
 
 
172 aa  49.7  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.43 
 
 
167 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>