296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3115 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  100 
 
 		 274 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  70.44 
 
 		 274 aa  411  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  61.54 
 
 		 275 aa  346  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  41.24 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  43.27 
 
 		 273 aa  234  9e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  40.88 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  38.69 
 
 		 262 aa  205  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  37.23 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  36.86 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  36.86 
 
 		 273 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  36.86 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  34.05 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  36.13 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  32.73 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  38.69 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  33.45 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  36.92 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  35.38 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  31.77 
 
 		 272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  33.94 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  33.21 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  34.15 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  30.91 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  31.82 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  28.79 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  28.57 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  29.78 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  30.94 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  27.02 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  28.01 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  28.46 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  27.44 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  30.07 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  26.76 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  26.67 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  28.28 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  29.41 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25.5 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  27.11 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.87 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  25.35 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.47 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.22 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  29.1 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  32.26 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.44 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.38 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.25 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.99 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.1 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  29.5 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.75 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  29.31 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.26 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.8 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.98 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.55 
 
 		 170 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.32 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.98 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.82 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.21 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  29.67 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.84 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  22.35 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  27.84 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  24.56 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  28.8 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  22.62 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.17 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  30.61 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  25.37 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.81 
 
 		 167 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  25.76 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.9 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  28.96 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.29 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  23.53 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  25.88 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  23.39 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  25.37 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  25.37 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  24.74 
 
 		 173 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  25.37 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  25.37 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  29.71 
 
 		 171 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  25.41 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  25.54 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  26.19 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  25.52 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.23 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  25.77 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  23.53 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  25.54 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  40.28 
 
 		 546 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.07 
 
 		 386 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  25.54 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  28.79 
 
 		 446 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  29.55 
 
 		 184 aa  53.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  25.95 
 
 		 188 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>