More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0485 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  100 
 
 
189 aa  384  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  92.06 
 
 
189 aa  344  3e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  92.06 
 
 
189 aa  340  7e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  53.93 
 
 
184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  37.31 
 
 
189 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  38.54 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  43.01 
 
 
186 aa  144  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  37.77 
 
 
187 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  36.99 
 
 
188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  35.06 
 
 
188 aa  128  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  38.74 
 
 
202 aa  125  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  36.21 
 
 
188 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  33.14 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  35.29 
 
 
194 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.52 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  34.2 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.52 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  31.75 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  31.61 
 
 
183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  36.78 
 
 
192 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  36.61 
 
 
185 aa  108  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.55 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  34.09 
 
 
176 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  36.63 
 
 
166 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  35.47 
 
 
166 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  28.19 
 
 
185 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  30.48 
 
 
345 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  33.53 
 
 
169 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  32.4 
 
 
169 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  32.8 
 
 
174 aa  99  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  33.53 
 
 
169 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  33.87 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  31.95 
 
 
169 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  31.28 
 
 
245 aa  94  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.56 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  32 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  32 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  31.36 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.99 
 
 
169 aa  92  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  26.74 
 
 
189 aa  91.7  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  31.94 
 
 
171 aa  92  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  26.84 
 
 
274 aa  90.5  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  30.53 
 
 
173 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  29.8 
 
 
173 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  29.75 
 
 
168 aa  87.8  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  31.55 
 
 
176 aa  87.8  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  29.17 
 
 
171 aa  87.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  32.22 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  29.8 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  31.05 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.95 
 
 
186 aa  84.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.64 
 
 
167 aa  84.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.95 
 
 
166 aa  84  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  30.39 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  27.07 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.98 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  28.57 
 
 
169 aa  82  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  31.35 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2018  nitroreductase  32.66 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.4 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  25.95 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  26.6 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.53 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  32.18 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  30.5 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  32.92 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  29.76 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.19 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  30.72 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  32.64 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  31.98 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  30 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  29.47 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  30.66 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  28.99 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  28.31 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  29.11 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  26.74 
 
 
277 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  30 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.78 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  25.27 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  26.42 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.5 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  29.79 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  27.88 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  26.49 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  27.54 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  27.81 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  26.06 
 
 
274 aa  72  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.49 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.72 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  30.18 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.32 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  26.4 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.93 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  28.34 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  27.72 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  24.28 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  31.72 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.02 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>