More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2980 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  100 
 
 
189 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  58.2 
 
 
191 aa  199  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  58.2 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  43.41 
 
 
187 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  40.96 
 
 
190 aa  148  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  44.62 
 
 
185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  40.66 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  35.56 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  37.28 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.89 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.25 
 
 
191 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  34.22 
 
 
194 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  35.5 
 
 
188 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  29.28 
 
 
345 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  34.46 
 
 
188 aa  91.3  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  33.54 
 
 
188 aa  91.3  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  30.73 
 
 
189 aa  91.3  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.57 
 
 
183 aa  91.3  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  28.57 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  35.06 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  28.42 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  32.93 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  34.88 
 
 
169 aa  88.6  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  31.67 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  33.52 
 
 
167 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  26.88 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  32.8 
 
 
170 aa  85.1  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  32.24 
 
 
167 aa  84.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  34.43 
 
 
196 aa  84.3  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.55 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  31.16 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.16 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  33.94 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  25.7 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.83 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.35 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.94 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  30.11 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  33.33 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  30.17 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  30.11 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  33.33 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  33.33 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.41 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  31.18 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.65 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.25 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  28.32 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  27.37 
 
 
287 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.19 
 
 
334 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.09 
 
 
252 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  30.57 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  33.57 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.81 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  33.72 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.05 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  31.03 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30 
 
 
178 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.77 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  27.78 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  34.59 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  30.23 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  30.46 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  30.81 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  32.31 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  27.93 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  27 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  34.08 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.28 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.82 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  34.35 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  31.07 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  31.36 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  32.2 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.94 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  28.71 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  35.66 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  30.22 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  27.62 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  27.62 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  27.46 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  35.38 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  31.28 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  25 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  26.74 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  30.33 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  30.99 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  32.47 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  30.3 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  29.58 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  29.94 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  29.94 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  27.23 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  27.72 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  27.23 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  27.36 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.32 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  27.36 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.74 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>