More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1200 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  100 
 
 
188 aa  391  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  44.13 
 
 
194 aa  174  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  38.5 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  37.82 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  33.33 
 
 
196 aa  135  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.94 
 
 
191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  33.15 
 
 
185 aa  125  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.91 
 
 
187 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  33.68 
 
 
184 aa  117  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  34.25 
 
 
191 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  34.25 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  33.53 
 
 
188 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  32.62 
 
 
189 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  32.09 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  36.31 
 
 
192 aa  115  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  30.81 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  32.62 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  31.55 
 
 
189 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  31.75 
 
 
189 aa  111  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  32.2 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  28.89 
 
 
189 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.78 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  34.25 
 
 
165 aa  99  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  30.6 
 
 
169 aa  98.2  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30 
 
 
170 aa  97.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  28.12 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.3 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  29.55 
 
 
169 aa  94.7  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.63 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  31.31 
 
 
334 aa  94.4  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  31.15 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.88 
 
 
166 aa  91.3  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.22 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.09 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.41 
 
 
166 aa  89  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.96 
 
 
166 aa  88.6  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.23 
 
 
184 aa  88.2  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.33 
 
 
163 aa  88.2  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  25.91 
 
 
245 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  24.35 
 
 
345 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.63 
 
 
186 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  28.34 
 
 
273 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  29.89 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  29.38 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.79 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.23 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.61 
 
 
186 aa  84.3  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.93 
 
 
278 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  28.81 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  28.81 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  27.75 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  29.12 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  27.47 
 
 
173 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  21.46 
 
 
287 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  27.47 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  28.26 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.6 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.24 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.7 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  31.05 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  26.14 
 
 
187 aa  79  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.57 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  29.31 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  28.65 
 
 
171 aa  79  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.58 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  26.9 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  26.92 
 
 
275 aa  78.2  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.43 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.41 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27.01 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  28 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  25.88 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.16 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  27.84 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  25.99 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.74 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  28.11 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  26.37 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  25.39 
 
 
274 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  24.56 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1363  nitroreductase  27.78 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.74 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  31.21 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  29.79 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  26.2 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.35 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  24.02 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  25.54 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  27.43 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  28.81 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  26.14 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  26.4 
 
 
277 aa  72  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  29.61 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  28.26 
 
 
272 aa  71.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  25.97 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.37 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  26.34 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  30.11 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>