More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0081 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  100 
 
 		 181 aa  377  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  61.58 
 
 		 178 aa  234  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  59.06 
 
 		 178 aa  221  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  62.57 
 
 		 171 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  38.27 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  35.12 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  33.33 
 
 		 178 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  35.85 
 
 		 176 aa  97.8  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.71 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.64 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  34.78 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  33.53 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  34.91 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  34.32 
 
 		 194 aa  88.6  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  33.73 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  32.82 
 
 		 190 aa  87.8  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  32 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  33.11 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  32.96 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  31.79 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  33.33 
 
 		 178 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  34.36 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  35.15 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.94 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.67 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  33.91 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  25.29 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  30.29 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.48 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  30.77 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  30.77 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.41 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  29.61 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  30.49 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  30.51 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  31.29 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  27.71 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.8 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.29 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.91 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.06 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.41 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  29.19 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.16 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  29.33 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  31.1 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.89 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  25.7 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  29.29 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1944  nitroreductase  27.78 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  28.89 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  30.46 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.65 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  28.85 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.93 
 
 		 386 aa  65.1  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.52 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  29.27 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  27.18 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  28.66 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.81 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  42.19 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  42.86 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  30.11 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  29.55 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0455  nitroreductase family protein  30.49 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  25.71 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  26.34 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  29.77 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  28.66 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  33.33 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  27.17 
 
 		 211 aa  62  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  24.77 
 
 		 212 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  29.83 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  27.01 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  29.47 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  24.77 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  24.88 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  31.03 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  29.55 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3233  nitroreductase  24.88 
 
 		 215 aa  60.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  31.75 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.61 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  29.38 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.14 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.92 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.07 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  32.65 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.56 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.07 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  50.98 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  29.05 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  29.38 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0326  nitroreductase  26.16 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  24.3 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  24.3 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  29.38 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  26.42 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.75 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  21.53 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>