125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0578 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  100 
 
 
193 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0326  nitroreductase  54.79 
 
 
191 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1944  nitroreductase  52.13 
 
 
189 aa  191  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  52.43 
 
 
217 aa  177  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  45.45 
 
 
192 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  46.81 
 
 
197 aa  175  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  45.99 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0375  nitroreductase  47.59 
 
 
196 aa  168  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0028718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0455  nitroreductase family protein  46.56 
 
 
197 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0956  nitroreductase  45.03 
 
 
191 aa  165  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000316504  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1413  nitroreductase family protein  44.74 
 
 
192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  44.15 
 
 
192 aa  160  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2259  nitroreductase  37.43 
 
 
192 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.62 
 
 
386 aa  108  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  35.36 
 
 
191 aa  108  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  30.49 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.82 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  31.25 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  30.57 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25.15 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  29.68 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30.32 
 
 
168 aa  62  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
163 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  28.85 
 
 
181 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.93 
 
 
186 aa  58.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  25.9 
 
 
275 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.33 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  28.22 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  25.66 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.47 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.33 
 
 
174 aa  55.5  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  26.97 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  26.97 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  26.97 
 
 
201 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.81 
 
 
170 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.26 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.04 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  28.37 
 
 
171 aa  52.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  26.32 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.5 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  28.89 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  28.89 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  24.72 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  31.85 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  24.06 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  24.34 
 
 
212 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  25 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  24.87 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  26.17 
 
 
180 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  26.32 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  21.62 
 
 
170 aa  48.5  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  24.05 
 
 
186 aa  48.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  22.29 
 
 
176 aa  48.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  24.16 
 
 
212 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  24.16 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.84 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.75 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  24.16 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  24.16 
 
 
212 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  26.74 
 
 
272 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25.81 
 
 
180 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  25 
 
 
201 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  26.7 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  23.7 
 
 
178 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  24.87 
 
 
287 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2891  nitroreductase  28.93 
 
 
340 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  23.6 
 
 
212 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  25 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  25.62 
 
 
271 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  26.56 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.03 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  24.24 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  25.3 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  25.78 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  25.33 
 
 
278 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  24.24 
 
 
252 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  24.48 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  26.06 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  24.48 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  24.48 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  24.48 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  24.4 
 
 
199 aa  45.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  24.48 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  24.29 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  23.95 
 
 
194 aa  45.1  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  23.71 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  24.05 
 
 
184 aa  44.7  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  25.77 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  23.71 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  24.48 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  25.73 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  30.72 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>