202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0676 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  100 
 
 
192 aa  394  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  64.02 
 
 
192 aa  259  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  61.26 
 
 
192 aa  254  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1413  nitroreductase family protein  61.9 
 
 
192 aa  246  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0455  nitroreductase family protein  58.2 
 
 
197 aa  229  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1944  nitroreductase  49.73 
 
 
189 aa  202  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0326  nitroreductase  50 
 
 
191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0375  nitroreductase  47.59 
 
 
196 aa  180  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0028718  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  45.99 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  46.67 
 
 
217 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  45.26 
 
 
197 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0956  nitroreductase  42.93 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000316504  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2259  nitroreductase  36.84 
 
 
192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  32.98 
 
 
191 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.33 
 
 
386 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  31.76 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  29.12 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.68 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  29.53 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.41 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  20.86 
 
 
212 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  20.74 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  20.74 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  22.39 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  20.86 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  20.86 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.88 
 
 
170 aa  58.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  25.75 
 
 
181 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.46 
 
 
176 aa  58.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  25.75 
 
 
163 aa  58.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  21.93 
 
 
212 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2826  nitroreductase family protein  23.93 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.27 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.75 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3040  nitroreductase family protein  23.93 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.66988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.48 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  20.32 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  26.63 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.07 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.47 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  29.63 
 
 
178 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  32.92 
 
 
181 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.99 
 
 
184 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  23.5 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  24.86 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  29.71 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  26.42 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  27.17 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  26.22 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  25.42 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  27.59 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  24.29 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.45 
 
 
163 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  27.93 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  22.16 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  27.78 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.32 
 
 
173 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  28.3 
 
 
240 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.42 
 
 
168 aa  52  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  24.24 
 
 
180 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  28.1 
 
 
189 aa  52  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  29.63 
 
 
181 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  29.63 
 
 
181 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  32.91 
 
 
171 aa  52  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  25.7 
 
 
200 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  22.7 
 
 
180 aa  51.2  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  26.52 
 
 
172 aa  51.2  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  25.79 
 
 
173 aa  51.6  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  23.96 
 
 
202 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  27.67 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  29.7 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  22.28 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.24 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  24.86 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  28.83 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  24.53 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.37 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  27.81 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  27.01 
 
 
173 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  24.69 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  22.78 
 
 
177 aa  48.9  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  23.6 
 
 
178 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  22.53 
 
 
200 aa  48.5  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1363  nitroreductase family protein  25.62 
 
 
169 aa  48.5  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  28.21 
 
 
245 aa  48.5  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  23.93 
 
 
186 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  28.12 
 
 
257 aa  48.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  26.14 
 
 
200 aa  48.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  24.68 
 
 
176 aa  48.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  27.06 
 
 
237 aa  48.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  31.33 
 
 
274 aa  48.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3233  nitroreductase  22.64 
 
 
215 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  27.92 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  24.53 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  22.79 
 
 
252 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  29.63 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  21.55 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  23.53 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  27.81 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.06 
 
 
221 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>