281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3562 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  100 
 
 
200 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  54 
 
 
214 aa  221  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  49.5 
 
 
201 aa  202  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  49.21 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  43.15 
 
 
200 aa  173  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  43.92 
 
 
223 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  41.67 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  37.44 
 
 
203 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  42.02 
 
 
201 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  40.51 
 
 
200 aa  148  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  42.08 
 
 
190 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  39.04 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  41.49 
 
 
201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  41.49 
 
 
201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  41.49 
 
 
201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  41.49 
 
 
201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  41.49 
 
 
201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  48.65 
 
 
151 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  41.49 
 
 
201 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  41.49 
 
 
201 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  38.66 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  39.68 
 
 
205 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  37.7 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  37.63 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  37.11 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  37.11 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  37.7 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  37.17 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  39.68 
 
 
197 aa  131  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  37.7 
 
 
201 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  38.14 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  39.9 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  39.9 
 
 
197 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  39.36 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  39.9 
 
 
197 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  38.83 
 
 
198 aa  128  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  35.68 
 
 
191 aa  128  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.84 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  36.76 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  38.5 
 
 
199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  36.9 
 
 
199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  36.81 
 
 
189 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  37.23 
 
 
198 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  36.6 
 
 
197 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  37.04 
 
 
199 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  36.41 
 
 
197 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  37.31 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  39.01 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  36.73 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  35 
 
 
197 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  36.7 
 
 
203 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  38.14 
 
 
233 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  36.73 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  39.13 
 
 
210 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  36.13 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  35.71 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  34.87 
 
 
197 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  34.55 
 
 
198 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  35.57 
 
 
200 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  35.42 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  36.26 
 
 
195 aa  112  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  39.49 
 
 
209 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  39.47 
 
 
209 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.39 
 
 
199 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  32.82 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  34.05 
 
 
212 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  38.26 
 
 
198 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  33.51 
 
 
199 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  32.99 
 
 
199 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  32.99 
 
 
199 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  35.11 
 
 
321 aa  104  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  34.57 
 
 
321 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  32.16 
 
 
199 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  36.11 
 
 
192 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  31.58 
 
 
214 aa  92  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  31.35 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  29.73 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  33.14 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.75 
 
 
330 aa  88.6  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  31.94 
 
 
194 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  32.04 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  28.49 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.27 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  32.5 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  27.08 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30.26 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.05 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  33.33 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31.69 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.1 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  31.28 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.78 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  27.51 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28.65 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  28.95 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  26.98 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.29 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  29.51 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  31.06 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  31.06 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>