134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1303 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  100 
 
 
199 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  75.92 
 
 
194 aa  291  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  68.62 
 
 
199 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  68.62 
 
 
199 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  67.55 
 
 
199 aa  251  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  46.11 
 
 
195 aa  141  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  42.63 
 
 
199 aa  131  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  38.22 
 
 
315 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  39.88 
 
 
210 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  38.62 
 
 
203 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  40.64 
 
 
201 aa  111  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  40.64 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  40.64 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  40.64 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  40.64 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  40.64 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  40.11 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  40.11 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  36.32 
 
 
223 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  39.27 
 
 
205 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  36.26 
 
 
198 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  38.42 
 
 
205 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  37.37 
 
 
197 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  39.04 
 
 
201 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  39.57 
 
 
201 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  39.57 
 
 
201 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  39.57 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  35.42 
 
 
199 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  36.9 
 
 
200 aa  99  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  39.04 
 
 
207 aa  99  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.07 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  37.43 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  34.43 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  38.5 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  38.5 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  33.51 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  37.43 
 
 
200 aa  94.4  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  37.43 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  33.51 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  34.85 
 
 
204 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  36.52 
 
 
201 aa  91.7  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  33.7 
 
 
195 aa  91.3  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  35.75 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  32.04 
 
 
197 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  32.04 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  35.33 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  32.95 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  32.62 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  34.64 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.88 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  40.11 
 
 
233 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  33.7 
 
 
200 aa  84.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  32.95 
 
 
197 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  32.95 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  35.56 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  32.95 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  30.77 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  32.26 
 
 
321 aa  81.6  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  31.72 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  33.15 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  28.26 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  35.33 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  30.56 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  30 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  40.11 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  36.59 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  28.65 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  31.25 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  34.32 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  30.48 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  39.67 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  28 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  30.34 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  35.29 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  27.08 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  39.49 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.38 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  29.73 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  28.11 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  32 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  32.03 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  30.23 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  33.73 
 
 
174 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  32.65 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  32.79 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  25.43 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  28.75 
 
 
188 aa  61.6  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  30.29 
 
 
170 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  30.11 
 
 
209 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  23.89 
 
 
212 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  23.89 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  24.02 
 
 
212 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  23.89 
 
 
212 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  23.33 
 
 
212 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  23.33 
 
 
212 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  29.07 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  30.32 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.13 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  22.22 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  30.82 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>