More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24750 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  100 
 
 
176 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  46.75 
 
 
174 aa  164  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  45.91 
 
 
176 aa  154  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  38.55 
 
 
170 aa  125  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  38.04 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  36.81 
 
 
179 aa  107  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  32.77 
 
 
178 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  35.29 
 
 
170 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  34.78 
 
 
178 aa  97.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  35.85 
 
 
181 aa  97.8  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  35.96 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.26 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  34.81 
 
 
171 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  33.53 
 
 
186 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.87 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  30.41 
 
 
163 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.39 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  33.33 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.52 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  29.44 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.87 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.41 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.3 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.21 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  31.25 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  31.25 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  31.25 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  31.25 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  31.25 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  29.01 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  31.25 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  31.85 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30.63 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  31.25 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.57 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  35.33 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25.99 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.5 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  30.2 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  30.87 
 
 
205 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  30.87 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  34.23 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.04 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  32.7 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  30 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  32.1 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.99 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  32.08 
 
 
201 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  32.08 
 
 
201 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  26.59 
 
 
278 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  32.9 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  32.68 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  31.9 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  25.77 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  26.67 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.46 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.42 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  26.29 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  23.08 
 
 
201 aa  67.4  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  28.48 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  32.65 
 
 
198 aa  67  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  31.1 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.9 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  26.02 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  26.37 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  26.37 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  29.38 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.4 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  25.9 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  27.11 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  25.68 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  25.9 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  30.61 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  25.99 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  30.26 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.1 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.04 
 
 
177 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  23.84 
 
 
321 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  23.72 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  23.84 
 
 
321 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  24.86 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  27.01 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  28.95 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  28.39 
 
 
329 aa  63.2  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  31.58 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.97 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  25 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  21.47 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  32 
 
 
176 aa  61.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  23.9 
 
 
166 aa  61.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.23 
 
 
194 aa  61.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  23.87 
 
 
171 aa  60.8  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  26.03 
 
 
169 aa  60.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  23.46 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1059  nitroreductase  23.64 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000184024  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  27.89 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  28.66 
 
 
215 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  23.95 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>