144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0225 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  100 
 
 		 200 aa  391  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  82.35 
 
 		 187 aa  293  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  44.89 
 
 		 315 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  40.64 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  42.66 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  39.55 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  38.64 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.43 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  38.51 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  38.64 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  36.93 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  36.93 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  39.88 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  37.11 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  38.55 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  36.02 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  36.36 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  34.97 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  38.12 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  36.36 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  36.36 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  36.61 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  35.8 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  33.71 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  32.96 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  32.45 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  38.33 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  36.21 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  34.29 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  34.29 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  36.41 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  35.56 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  31.64 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  34.86 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  35.63 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  36.99 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  38.41 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  34.05 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  36.99 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  36.99 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  35.23 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  36.07 
 
 		 192 aa  92  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  34.78 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  34.62 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  35.76 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  32.6 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  30.22 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  33.71 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  28.57 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  33.52 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  38.2 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  37.58 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  41.27 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  28.25 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  35.19 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  32.75 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  34.55 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  30.85 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  34.59 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  35.71 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  32.95 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  31.15 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  34.88 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.72 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  31.15 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  30.6 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  39.63 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  40.24 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  40.24 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  34.68 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  31.41 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  32.05 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  28.33 
 
 		 174 aa  62  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  29.34 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  30.52 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  30.52 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.16 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  27.84 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.07 
 
 		 330 aa  54.7  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  25.68 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.33 
 
 		 163 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  28.85 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.75 
 
 		 174 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  52.94 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.54 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  38.24 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.67 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.71 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2213  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.23 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0138908  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  30.9 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  28.48 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>