172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0264 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  100 
 
 
187 aa  362  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  82.35 
 
 
200 aa  289  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  43.5 
 
 
315 aa  137  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  42.02 
 
 
210 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  43.81 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  44.22 
 
 
199 aa  114  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  38.8 
 
 
201 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  38.8 
 
 
201 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  38.8 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  38.8 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  38.8 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  38.8 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  38.8 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  40.34 
 
 
194 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.43 
 
 
199 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  39.62 
 
 
195 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  35.87 
 
 
203 aa  104  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  37.36 
 
 
198 aa  104  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  39.26 
 
 
200 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  37.84 
 
 
201 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  35.52 
 
 
198 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  32.97 
 
 
200 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  35.56 
 
 
197 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  36.87 
 
 
207 aa  98.2  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  37.5 
 
 
199 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  33.88 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  34.44 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  34.83 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  37.36 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  37.36 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  33.52 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  34.81 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  36.81 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  36.59 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  37.16 
 
 
199 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  37.16 
 
 
199 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  37.36 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  36.61 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  35.68 
 
 
212 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  36.26 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  33.7 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  35.75 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  35.75 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  31.64 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  35.84 
 
 
197 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  32.78 
 
 
199 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  35.84 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  33.14 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  35.84 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  32.22 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  35.63 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  35.06 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  35.75 
 
 
192 aa  88.2  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  37.13 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  30.77 
 
 
199 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  35.2 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  33.52 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  34.57 
 
 
199 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  40.74 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  33.33 
 
 
201 aa  85.1  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  28.81 
 
 
191 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  34.15 
 
 
195 aa  84.7  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  30.11 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  35.39 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  34.38 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  38.37 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  31.15 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.3 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  30 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  30.94 
 
 
204 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  29.44 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  29.44 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  37.42 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  32.35 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  36.29 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  38.32 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  37.13 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  38.32 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  32.05 
 
 
321 aa  62.8  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  31.41 
 
 
321 aa  62  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  32.08 
 
 
171 aa  58.2  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  32.08 
 
 
171 aa  58.2  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  26.49 
 
 
174 aa  57.8  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  28.49 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  33.08 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  25 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.38 
 
 
174 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  26.14 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.93 
 
 
330 aa  52  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.75 
 
 
183 aa  51.2  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  30.46 
 
 
169 aa  51.2  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  31.33 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  31.13 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  31.85 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  22.73 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  29.89 
 
 
218 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2213  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.19 
 
 
227 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0138908  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  29.61 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  37.31 
 
 
188 aa  48.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>