134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10883 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  100 
 
 
197 aa  413  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  41.67 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  39.29 
 
 
223 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  37.76 
 
 
213 aa  141  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  40 
 
 
201 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  39.06 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  40 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  40.1 
 
 
199 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  37.95 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  37.95 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  37.44 
 
 
201 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  38.42 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  36.92 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  36.99 
 
 
191 aa  124  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  36.92 
 
 
201 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  36.41 
 
 
201 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  36.41 
 
 
207 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  36.73 
 
 
197 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  36.22 
 
 
205 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  35.29 
 
 
189 aa  121  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  37.91 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  38.12 
 
 
200 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  35.78 
 
 
203 aa  118  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  35.9 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  35.9 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  37.04 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  34.74 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  35.9 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  35.9 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  35.9 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  35.9 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  35.9 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  35.29 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  34.52 
 
 
199 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  35.26 
 
 
197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  32.83 
 
 
200 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  35.57 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  36.13 
 
 
197 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  35.6 
 
 
197 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  34.59 
 
 
198 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  35.42 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  35.42 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  40.85 
 
 
151 aa  111  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  34.34 
 
 
203 aa  110  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  35.42 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  34.21 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  35.03 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  38.27 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  37.34 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  35.18 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  34.85 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  34.67 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  36.17 
 
 
205 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.55 
 
 
199 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  31.16 
 
 
199 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  35.64 
 
 
192 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  38.31 
 
 
195 aa  102  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  37.04 
 
 
199 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.21 
 
 
199 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  34.01 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  36.48 
 
 
190 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  33.16 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  33.15 
 
 
233 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  38.3 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  33.14 
 
 
187 aa  91.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  29.63 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  34.07 
 
 
209 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  32.43 
 
 
315 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  30.05 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  28.06 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  32.42 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  34.86 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  30.53 
 
 
194 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  28.8 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  30.41 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  29.9 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  29.9 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  28.65 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  30.48 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  30.77 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  31.71 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  31.71 
 
 
321 aa  65.5  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
330 aa  63.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.75 
 
 
170 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  27.45 
 
 
181 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  26.83 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  25.32 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  28.19 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  24.53 
 
 
174 aa  55.1  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  28.48 
 
 
186 aa  55.1  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  26.17 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  26.75 
 
 
180 aa  53.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  26.92 
 
 
178 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  24.72 
 
 
187 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  28.74 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25.77 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  23.08 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  25 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.03 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  26.35 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>