More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0617 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  100 
 
 
169 aa  349  1e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  90.53 
 
 
171 aa  322  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  90.53 
 
 
171 aa  322  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  88.17 
 
 
169 aa  311  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  58.43 
 
 
176 aa  209  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  56.17 
 
 
163 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  50.3 
 
 
169 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  47.93 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  47.34 
 
 
169 aa  174  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  52.07 
 
 
169 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  45.56 
 
 
174 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  46.75 
 
 
169 aa  166  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  45.18 
 
 
166 aa  164  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  44.58 
 
 
166 aa  162  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  50.88 
 
 
170 aa  159  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  47.93 
 
 
174 aa  158  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  46.63 
 
 
169 aa  157  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  45.56 
 
 
173 aa  157  8e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  43.2 
 
 
171 aa  151  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  41.07 
 
 
173 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  39.29 
 
 
173 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  41.07 
 
 
173 aa  148  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  40.59 
 
 
201 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  43.79 
 
 
169 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  39.29 
 
 
187 aa  134  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  38.41 
 
 
171 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  40 
 
 
274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  35.19 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  37.58 
 
 
169 aa  120  9e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  39.02 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  34.5 
 
 
197 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  38.55 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  35.33 
 
 
167 aa  108  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  35.8 
 
 
176 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  35.53 
 
 
169 aa  103  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  34.36 
 
 
173 aa  100  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  35.29 
 
 
170 aa  100  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  41.18 
 
 
167 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.01 
 
 
166 aa  98.2  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  31.98 
 
 
175 aa  97.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  35.44 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  33.9 
 
 
194 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.91 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  34.18 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  33.33 
 
 
194 aa  95.5  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.45 
 
 
184 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  34.46 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  32.3 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  35.37 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.94 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  32.43 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  32.43 
 
 
214 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  31.37 
 
 
173 aa  90.9  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.38 
 
 
186 aa  90.9  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  32.48 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.79 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  30.46 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.05 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  31.58 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  33.33 
 
 
189 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  32.4 
 
 
189 aa  89  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  31.41 
 
 
195 aa  89  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  31.25 
 
 
176 aa  88.2  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  33.33 
 
 
191 aa  87.8  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  30.46 
 
 
172 aa  87.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  36.42 
 
 
174 aa  87.4  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  29.63 
 
 
180 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  29.31 
 
 
176 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32.52 
 
 
168 aa  87  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  87  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  34.3 
 
 
184 aa  87  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.68 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.33 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  32.14 
 
 
202 aa  85.1  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  31.54 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.24 
 
 
168 aa  84.7  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  31.11 
 
 
185 aa  84  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.49 
 
 
171 aa  84.3  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.88 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.82 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.88 
 
 
278 aa  81.3  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  29.45 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  32 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.81 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  30.81 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.26 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  35.11 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  32.75 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  38.46 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  31.85 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  29.38 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  29.14 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.57 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  28.89 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.7 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  28.14 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  31.55 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  34.19 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  33.33 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  30.18 
 
 
188 aa  73.9  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>