More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1183 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  100 
 
 
175 aa  357  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  53.85 
 
 
176 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  51.45 
 
 
176 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  52.91 
 
 
182 aa  177  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  50 
 
 
173 aa  177  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  52.33 
 
 
195 aa  175  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  48.55 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  52.69 
 
 
170 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  51.16 
 
 
172 aa  167  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  48.84 
 
 
172 aa  164  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  49.42 
 
 
173 aa  155  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  50.65 
 
 
170 aa  148  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  37.87 
 
 
172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  42.44 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  37.06 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  38.73 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  34.57 
 
 
169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  39.07 
 
 
163 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  36.48 
 
 
170 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  34.29 
 
 
170 aa  105  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  33.91 
 
 
167 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  34.46 
 
 
174 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  36.13 
 
 
278 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  34.59 
 
 
171 aa  102  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  36.14 
 
 
178 aa  101  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  37.79 
 
 
194 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  31.84 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  32.56 
 
 
169 aa  99  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  33.33 
 
 
166 aa  99  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  31.98 
 
 
169 aa  97.8  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.61 
 
 
184 aa  97.8  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  34.3 
 
 
178 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.81 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  33.13 
 
 
176 aa  97.4  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  33.55 
 
 
169 aa  97.4  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  37.27 
 
 
194 aa  97.4  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.33 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  32.93 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.93 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  36.88 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  35.76 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.79 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  29.31 
 
 
197 aa  92.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  29.07 
 
 
171 aa  92  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  29.07 
 
 
171 aa  92  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.61 
 
 
186 aa  91.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  31.21 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.54 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  30.46 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.9 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  33.33 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  30.46 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  30.54 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  30.46 
 
 
173 aa  89  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  30.46 
 
 
169 aa  89  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30.67 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  32.89 
 
 
176 aa  88.2  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  30.46 
 
 
173 aa  87.8  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
163 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  32.37 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.25 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  29.94 
 
 
274 aa  84.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  29.76 
 
 
176 aa  84.3  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.02 
 
 
187 aa  84.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  30.77 
 
 
169 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.48 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.72 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  31.82 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  27.59 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  27.43 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  32.26 
 
 
188 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  32.56 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  33.14 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  32.57 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  26.52 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  25.64 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  28.99 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  27.93 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  28.32 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  30.73 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  34.09 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.3 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.68 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  29.05 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  27.93 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  27.27 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  34.13 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.82 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  25.44 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  30 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  25.28 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  28.18 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.78 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  28.02 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.47 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  30.21 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.34 
 
 
190 aa  67.4  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.57 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  23.84 
 
 
202 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.67 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>