More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1141 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  100 
 
 
171 aa  343  5e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  50 
 
 
166 aa  186  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  41.07 
 
 
166 aa  165  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  41.07 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  44.64 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  46.67 
 
 
167 aa  160  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  45.24 
 
 
169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  37.65 
 
 
173 aa  153  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  37.06 
 
 
173 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  40.59 
 
 
173 aa  151  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  36.47 
 
 
173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  41.21 
 
 
166 aa  149  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  41.42 
 
 
169 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  39.77 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  41.89 
 
 
163 aa  144  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  38.69 
 
 
169 aa  141  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  36.9 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  42.77 
 
 
170 aa  136  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  41.67 
 
 
171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  41.67 
 
 
171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  38.41 
 
 
169 aa  130  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  41.98 
 
 
169 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  37.87 
 
 
169 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  39.58 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  38.1 
 
 
174 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  34.5 
 
 
187 aa  122  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  34.71 
 
 
201 aa  120  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  37.13 
 
 
169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  38.55 
 
 
169 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  35.86 
 
 
171 aa  110  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  32.35 
 
 
197 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  36.24 
 
 
170 aa  104  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  34.21 
 
 
167 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  32.19 
 
 
180 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  34.64 
 
 
170 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  32.74 
 
 
274 aa  98.2  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  36.05 
 
 
177 aa  98.2  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  27.38 
 
 
169 aa  97.4  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.56 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.36 
 
 
167 aa  94.4  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.01 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  28.99 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  28.65 
 
 
176 aa  84.7  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  32.24 
 
 
170 aa  84.3  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.92 
 
 
173 aa  84  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  31.82 
 
 
172 aa  84  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.52 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.76 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.65 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  27.43 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.65 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  31.98 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  34.81 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  34.81 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  27.01 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  31.95 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  31.36 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31.37 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.14 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.24 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.65 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.41 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.19 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  27.01 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  28.16 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  29.31 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.95 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  28.57 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.77 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  29.61 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.65 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  30.67 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.33 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  26.53 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.59 
 
 
202 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  30.26 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  25.15 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  33.92 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  35.65 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  25.86 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  24 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  29.66 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  25.33 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  25.42 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.07 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.38 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  29.55 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.07 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  31.64 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  31.54 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  26.19 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  35.07 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  27.01 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  27.78 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  28.74 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.38 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.04 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1059  nitroreductase  29.8 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000184024  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>