More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1660 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  100 
 
 
175 aa  363  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  64.57 
 
 
175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  56.57 
 
 
175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  58.29 
 
 
175 aa  214  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  54.29 
 
 
175 aa  186  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  43.71 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  43.75 
 
 
192 aa  136  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  46.58 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  37.43 
 
 
170 aa  114  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  45.61 
 
 
173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  33.33 
 
 
176 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  35.06 
 
 
178 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  36.2 
 
 
174 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  31.4 
 
 
329 aa  94.4  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.71 
 
 
194 aa  94.4  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  29.71 
 
 
194 aa  94  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  34.24 
 
 
183 aa  91.7  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.12 
 
 
186 aa  90.9  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.22 
 
 
186 aa  90.9  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  35.59 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  31.21 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.73 
 
 
184 aa  88.6  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  30.29 
 
 
180 aa  88.6  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.48 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  25.62 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  29.24 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  29.07 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.91 
 
 
166 aa  82  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.06 
 
 
165 aa  82  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  29.61 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  30.34 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  29.94 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.65 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.43 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.65 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  30.81 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.22 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  31.08 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  26.52 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  31.29 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  29.14 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  28.57 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  28.49 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.74 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.92 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  34 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  29.71 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  27.98 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  28.81 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  33.75 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  30.06 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  25.6 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  27.98 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27.65 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  27.43 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  27.43 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  24.12 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.51 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  27.91 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  26.55 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  34.48 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  31.65 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  25.68 
 
 
202 aa  72  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.96 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  31.82 
 
 
273 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  28.98 
 
 
273 aa  71.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  27.54 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  26.09 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  27.54 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  30.77 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  30 
 
 
274 aa  70.9  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  27.54 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.09 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  27.84 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  25.14 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  28 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  28 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  27 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  26.9 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.35 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  40.43 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  25.35 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  24.88 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  24.88 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  28 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  24.88 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  28 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  34.86 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  24.88 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  29.41 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  24.88 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  29.41 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  25.85 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  28.73 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.82 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  28.82 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.35 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  27.33 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>