More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1448 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  56.21 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  52.1 
 
 
168 aa  187  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  52.41 
 
 
171 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  43.18 
 
 
173 aa  156  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  41.67 
 
 
166 aa  132  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  41.3 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  41.82 
 
 
170 aa  125  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.48 
 
 
163 aa  107  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  36.11 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  33.33 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  36.42 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  36.99 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  36.99 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.71 
 
 
174 aa  94  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  39.13 
 
 
171 aa  92  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  34.57 
 
 
167 aa  91.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  33.93 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  34.97 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  33.33 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  36.2 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  34.23 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.74 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  34.71 
 
 
176 aa  89  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  32.89 
 
 
175 aa  88.2  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  33.33 
 
 
169 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  32.87 
 
 
169 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  33.76 
 
 
278 aa  87  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  29.53 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  34.04 
 
 
169 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  31.54 
 
 
170 aa  85.5  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  31.93 
 
 
169 aa  84.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  32.64 
 
 
169 aa  84.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  30.92 
 
 
173 aa  84.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  35.06 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  34.64 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  31.52 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  33.33 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  31.21 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  31.21 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  32.88 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  30.14 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  32.41 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  32.14 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  32.62 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  30.2 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  33.1 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  30.54 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  29.34 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.96 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  31.58 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  33.09 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  33.33 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  31.45 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  27.71 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  38.36 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28.14 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.93 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  29.61 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  36.88 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.6 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  30.87 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.79 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32.21 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  30.5 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  26.99 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  34.34 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.88 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  30.18 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.52 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  34.36 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  28.97 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.88 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.53 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  27.89 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  30 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.63 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.35 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  28.66 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.81 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  32.92 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  32.41 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  33.95 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  33.33 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  29.65 
 
 
248 aa  70.9  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.71 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  30.82 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  33.08 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  29.45 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  31.87 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  29.19 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  34.11 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  31.51 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.41 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  26.6 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  26.94 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  28.3 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  29.24 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  25.85 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  28.86 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>