More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0470 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  100 
 
 		 171 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  62.5 
 
 		 168 aa  229  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  56.8 
 
 		 176 aa  221  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  56.63 
 
 		 173 aa  206  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  52.41 
 
 		 176 aa  187  9e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  40.25 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  40.54 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  34.57 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  31.43 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  32.65 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  32.65 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  33.55 
 
 		 174 aa  94.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.22 
 
 		 187 aa  91.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  26.97 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  33.77 
 
 		 176 aa  91.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  32.17 
 
 		 169 aa  90.9  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.03 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  30.23 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29.45 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.95 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  31.25 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  30.77 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  30.71 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  30.25 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  27.33 
 
 		 176 aa  84.3  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.77 
 
 		 173 aa  84  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  30.11 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.62 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  29.41 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  29.25 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.27 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  29.73 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.33 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.27 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  30.87 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.88 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  31.91 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  28.95 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  31.54 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.99 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  27.81 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  33.13 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  28.87 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  33.33 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  30.25 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  25.64 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  31.54 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  26.21 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  30.67 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  26.49 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  25.15 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  31.51 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  29.53 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  25.85 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  32.34 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  30.06 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.22 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.57 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.12 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  26.92 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.73 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.16 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.19 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  24.54 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  27.7 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.92 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  29.11 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  25 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.9 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.66 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  26.97 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  32.08 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  24.84 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.67 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.44 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  26.95 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  26.95 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.3 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  24.84 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  26.47 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  26.35 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.94 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  27.22 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  29.44 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  27.85 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.85 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  26.53 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  30.61 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.74 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  30.14 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  26.58 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  31.51 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  27.03 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  30.71 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  29.06 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  26.26 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  29.37 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>