More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2684 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  100 
 
 
178 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  61.58 
 
 
181 aa  234  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  60.23 
 
 
178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  59.65 
 
 
171 aa  211  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  40.24 
 
 
170 aa  117  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  41.62 
 
 
178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  39.18 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  36.84 
 
 
176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  36.84 
 
 
174 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.73 
 
 
179 aa  100  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  34.78 
 
 
176 aa  97.8  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  36.42 
 
 
168 aa  98.2  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  33.14 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  35.2 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  34.29 
 
 
194 aa  91.3  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  34.29 
 
 
194 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  32.47 
 
 
172 aa  90.5  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  33.53 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  32.21 
 
 
176 aa  87.4  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  31.15 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  32.54 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  32.57 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  33.33 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.41 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.25 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.55 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  30.39 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  30.39 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.81 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  32.76 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  33.72 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30.23 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  35.29 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  28.49 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.97 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  30.2 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  28.26 
 
 
321 aa  72  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  31.11 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  27.72 
 
 
321 aa  71.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  30.11 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.88 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.73 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  31.46 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  36.51 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  26.96 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.23 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  31.76 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  26.14 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.22 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  26.82 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.49 
 
 
330 aa  68.2  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  32.61 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  28.87 
 
 
232 aa  67  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  29.83 
 
 
210 aa  67  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  30.34 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  27.59 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  29.03 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  26 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  33.33 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  32.76 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  32.37 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  24.53 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  31.36 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  31.84 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.3 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  26.5 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  29.89 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30.11 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.95 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  24.53 
 
 
212 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  32.76 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  28.74 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.29 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  32.39 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  24.53 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.29 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  32.77 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  27.37 
 
 
275 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.49 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  24.53 
 
 
212 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  29.28 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  26.92 
 
 
211 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.36 
 
 
222 aa  62.4  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  31.58 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  29.66 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  24.06 
 
 
212 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  29.33 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  28.21 
 
 
223 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  24.88 
 
 
208 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  24.06 
 
 
212 aa  62  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  24.53 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  31.25 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.13 
 
 
190 aa  62  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  31.82 
 
 
174 aa  61.6  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  29.68 
 
 
193 aa  61.6  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  30.26 
 
 
201 aa  61.6  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  24.06 
 
 
212 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  28.72 
 
 
350 aa  61.6  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  27.61 
 
 
192 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>