More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1167 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  100 
 
 
174 aa  355  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  65.29 
 
 
174 aa  229  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  45.51 
 
 
192 aa  135  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  46.58 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  42.01 
 
 
170 aa  129  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  47.34 
 
 
173 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  37.04 
 
 
165 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  42.86 
 
 
174 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  42.77 
 
 
175 aa  121  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  39.31 
 
 
178 aa  121  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  36.42 
 
 
194 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  36.99 
 
 
194 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  40.26 
 
 
166 aa  111  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  40.26 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  38.95 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  44.17 
 
 
175 aa  108  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  34.43 
 
 
186 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  40.85 
 
 
176 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  30.37 
 
 
204 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  34.24 
 
 
186 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  34.12 
 
 
176 aa  104  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  33.7 
 
 
186 aa  104  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  37.36 
 
 
188 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  37.89 
 
 
175 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  34.97 
 
 
170 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  34.73 
 
 
176 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  38.46 
 
 
183 aa  100  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  37.28 
 
 
169 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  35.33 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  39.22 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.61 
 
 
184 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  36.09 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  33.73 
 
 
163 aa  99.4  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  35.09 
 
 
168 aa  97.8  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  35.22 
 
 
215 aa  97.4  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  36.41 
 
 
235 aa  97.1  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  36.2 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  32.28 
 
 
190 aa  94  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  34.88 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  34.65 
 
 
348 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.09 
 
 
278 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  33.15 
 
 
350 aa  92.8  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  34.55 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  37.06 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  34.91 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  39.74 
 
 
169 aa  91.7  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  33.91 
 
 
181 aa  91.3  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  33.13 
 
 
171 aa  91.3  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  30.68 
 
 
180 aa  91.3  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  35.57 
 
 
163 aa  91.3  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  35.09 
 
 
180 aa  90.9  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  32.3 
 
 
201 aa  90.9  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  34.68 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  31.87 
 
 
214 aa  90.1  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  32.92 
 
 
329 aa  90.5  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.32 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  33.74 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  37.35 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  31.17 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.29 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  37.65 
 
 
169 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  32.65 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  35.03 
 
 
190 aa  88.6  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  36.71 
 
 
172 aa  87.8  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  38.31 
 
 
169 aa  87.4  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.04 
 
 
169 aa  87.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  30.86 
 
 
173 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  35.5 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  37.82 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  37.82 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  29.79 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  36.07 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  38.71 
 
 
274 aa  85.5  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  33.12 
 
 
171 aa  85.5  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  30.43 
 
 
261 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.96 
 
 
584 aa  84.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  31.87 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  35.11 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.2 
 
 
814 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  30.86 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  35.14 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.89 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  33.55 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  33.17 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.86 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  30.86 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  33.93 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 
982 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.89 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.68 
 
 
171 aa  82  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  32.16 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  32.16 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  30.36 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  33.77 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  31.87 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  30.61 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  30.86 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  32.07 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  37.86 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  30.3 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>