228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1478 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  100 
 
 
235 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  72.34 
 
 
237 aa  348  4e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  71.24 
 
 
274 aa  328  3e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  64.38 
 
 
234 aa  305  3e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  52.63 
 
 
202 aa  201  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  47.29 
 
 
221 aa  201  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  54.19 
 
 
242 aa  186  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  53.62 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  47.52 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  43.54 
 
 
250 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  41.87 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  49.01 
 
 
225 aa  165  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  42.86 
 
 
205 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  43.23 
 
 
189 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  41.46 
 
 
207 aa  143  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  42.03 
 
 
382 aa  135  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  34.3 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  37.26 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  38.94 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  40 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  39.09 
 
 
254 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  37.95 
 
 
259 aa  108  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  37.37 
 
 
253 aa  106  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  35.35 
 
 
246 aa  105  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  31.94 
 
 
252 aa  104  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  38.46 
 
 
251 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  37.81 
 
 
259 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  34 
 
 
253 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  37.56 
 
 
257 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  38.31 
 
 
255 aa  102  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  36.68 
 
 
248 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  37.56 
 
 
354 aa  102  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  36.68 
 
 
222 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  30.66 
 
 
202 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  34.48 
 
 
218 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  36.49 
 
 
249 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  34.6 
 
 
246 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  34.57 
 
 
284 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  41.58 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  37.81 
 
 
252 aa  98.6  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  36.19 
 
 
255 aa  98.6  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  37.57 
 
 
174 aa  98.6  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  35.38 
 
 
508 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  35.38 
 
 
508 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  34.66 
 
 
203 aa  96.7  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  34.52 
 
 
252 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  36.82 
 
 
250 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  35.1 
 
 
375 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  29.91 
 
 
371 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  35.05 
 
 
510 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  35.68 
 
 
503 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  36.95 
 
 
221 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  34.48 
 
 
217 aa  91.7  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  31.37 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  34.48 
 
 
262 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  35.5 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  34.48 
 
 
305 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  34.48 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  34.54 
 
 
510 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  34.48 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  34.48 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  34.48 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  34.48 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  33.5 
 
 
282 aa  89  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  35.29 
 
 
252 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  33 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  35.96 
 
 
221 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  37.44 
 
 
203 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  32.55 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  30.96 
 
 
218 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  33.84 
 
 
509 aa  85.5  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  36.22 
 
 
256 aa  85.5  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  36.41 
 
 
174 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  33.33 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  31.19 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  37.86 
 
 
461 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  41.18 
 
 
530 aa  78.6  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  33.17 
 
 
473 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  28.86 
 
 
193 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  34.41 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  32.38 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  31.22 
 
 
523 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  37.04 
 
 
458 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  35.07 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  32.42 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  31.9 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  32.39 
 
 
474 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  30.96 
 
 
475 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.9 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  37.41 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  30.37 
 
 
175 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  29.1 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  34.3 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  32.57 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  33.55 
 
 
546 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  34.87 
 
 
391 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  40.91 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  36.44 
 
 
518 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>