More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0440 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  100 
 
 
201 aa  413  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  55.73 
 
 
197 aa  228  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  41.21 
 
 
176 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  40 
 
 
174 aa  148  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  40.35 
 
 
169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  40.59 
 
 
169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  36.9 
 
 
173 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  35.12 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  35.71 
 
 
166 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  35.12 
 
 
173 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  35.71 
 
 
173 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  35.71 
 
 
173 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  38.82 
 
 
171 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  38.82 
 
 
171 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  40.59 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  38.24 
 
 
169 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  36.47 
 
 
169 aa  131  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  41.76 
 
 
169 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  38.41 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  39.41 
 
 
169 aa  128  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  35.88 
 
 
171 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  36.97 
 
 
174 aa  122  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  34.73 
 
 
169 aa  121  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  34.71 
 
 
171 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  32.75 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  32.52 
 
 
169 aa  115  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  38.37 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  33.92 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.92 
 
 
165 aa  111  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  30.3 
 
 
166 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.36 
 
 
166 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  35.67 
 
 
274 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  34.52 
 
 
166 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  39.16 
 
 
169 aa  97.8  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  32.75 
 
 
176 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  33.14 
 
 
169 aa  94.7  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  31.79 
 
 
170 aa  92.8  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.52 
 
 
174 aa  91.7  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.99 
 
 
173 aa  91.3  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32.77 
 
 
176 aa  90.1  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  34.23 
 
 
176 aa  89.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  32.08 
 
 
167 aa  88.2  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  33.77 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.48 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  31.95 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  28.25 
 
 
175 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.27 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  30.87 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.75 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  33.96 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  32.9 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  29.21 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30.95 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  28.22 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.33 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  29.76 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.76 
 
 
178 aa  79  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  32.2 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  29.63 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  30.34 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.16 
 
 
178 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.67 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.04 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.07 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  27.63 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.04 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  29.71 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  27.81 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  32.3 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.65 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  28.12 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  29.25 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  29.3 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.68 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.2 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  27.17 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  28.03 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  25.86 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  28.89 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25.54 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  27.98 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  29.59 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.1 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.75 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  27.95 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  25.93 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.82 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  29.09 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  29.09 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25.13 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  28.24 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  28.3 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  29.21 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  27.27 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  28.65 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  28.48 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.8 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  28.21 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.44 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  29.41 
 
 
368 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>